Feb, 2014
利用稀疏线性回归从微生物组时间序列识别人类肠道微生物组的关键物种
Identifying Keystone Species in the Human Gut Microbiome from Metagenomic Timeseries using Sparse Linear Regression
Charles K. Fisher, Pankaj Mehta
TL;DR通过稀疏线性回归与 bootstrap 聚合方法，利用 LIMITS 模型对微生物动力学的时序模型进行推断。我们测试了 LIMITS 模型在合成数据上的可靠性，并将其应用到两个人的肠道菌群中以表征其物种间的相互作用网络，发现这些网络受关键物种的显著影响，这些关键物种可能是导致人类肠道微生态个体差异的因素。