朝着符合实验观测的经验力场

Apr, 2020

Towards empirical force fields that match experimental observables

Thorben Fröhlking, Mattia Bernetti, Nicola Calonaci, Giovanni Bussi

TL;DR本文综述了基于分子动力学模拟和溶液实验数据的生物分子力场方法，讨论了该方法的机器学习相关问题和挑战。

Abstract

biomolecular force fields have been traditionally derived based on a mixture of reference quantum chemistry data and experimental information obtained on small fragments. However, the possibility to run extensive molecular dynamics simulations on larger systems achieving ergodic sampli

biomolecular force fields molecular dynamics simulations macromolecular systems machine learning methods open challenges

发现论文，激发创造

利用机器学习力场实现精确分子动力学模拟

通过将时空物理对称性结合到梯度域机器学习（sGDML）模型中，从高级初步计算中直接构建灵活的分子力场，为实现分子模拟中的光谱精度提供关键缺失成分。

Feb, 2018

准确的机器学习力场通过实验和模拟数据融合

基于机器学习的势场吸引着越来越多的关注，因为它们能够以量子级准确度跨越经典间原子势场的时空尺度。本研究利用密度泛函理论计算和实验测量的力学性能及晶格参数来训练钛的机器学习势能模型，证明了融合数据学习策略能够同时满足所有目标要求，从而获得比单一数据来源训练的模型更高准确性的分子模型。该方法适用于任何材料，可作为获取高度精确机器学习势能的通用策略。

Aug, 2023

用分子力场进行可微转角采样

本文介绍一种基于神经网络的 Boltzmann 生成器，以取代传统 molecular dynamics 方法，加速复杂大分子如蛋白质的能量表面探索。

Feb, 2023

基于自上而下的机器学习法推导蛋白质粗粒度力场

使用分子动力学仿真和可微重要性抽样训练神经网络势能，可以开发出准确和高效的蛋白质粗粒化表示方法，在预测蛋白质动力学、折叠和相互作用等方面具有重要应用价值。

Jun, 2023

机器学习力场

本文总结了机器学习在计算化学中的应用，包括基于机器学习的力场构建、相关的统计关系和挑战，并提供了从零开始构建和测试它们的逐步指南。

Oct, 2020

极端力学力场中的规划和探索方法

通过第一性原理计算生成的数据，我们开发了一个神经网络力场 NN-F3 来研究断裂，通过预先对应变态空间进行采样和积极学习技术来探索临界键合距离处的过渡态。模拟结果验证了最近的实验发现，并强调在预测极端机械过程中包括从第一性原理计算中获取的电子结构知识的必要性。