May, 2020

NuClick: 一个用于显微镜图像交互式分割的深度学习框架

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TL;DR本论文提出了一种基于 CNN 的方法 NuClick，可以快速收集核、细胞，以及腺体细胞等许多应用于计算机病理学 / 细胞学的计算机处理对象的注释，并提出了一种新的引导信号，使 NuClick 能够分割腺体的边界。在实验证明，NuClick 能够适应不同的目标尺度，对用户输入的不同变化具有强大的鲁棒性，并且提供可靠的标注，对它标准产生的实例分割模型在 LYON19 挑战中获得了第一名。
object segmentationcomputational pathologycnn-based approachnuclicksupervisory signals
发现论文，激发创造
  • NuCLS: 一种可扩展的众包深度学习方法与数据集，用于细胞核分类、定位和分割

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    Feb, 2021

  • NuInsSeg：H＆E 染色组织学图像中核实例分割的全面注释数据集

    我们发布了一个大规模的手工标注的细胞核数据集 NuInsSeg，其中包含来自 31 个人和小鼠器官的 665 个图像补丁，超过 30,000 个手动分割的细胞核。此外，我们首次提供了整个数据集的模糊区域掩模，用于表示图像的某些部分即使对于人类专家来说也无法精确和确定地进行手动注释。

    Aug, 2023

  • Micro-Net: 一种用于显微镜图像中多种物体分割的统一模型

    本文基于 CNN 的深度学习结构，针对显微镜图像中的目标分割和结构定位问题进行了研究，经过多重分辨率训练和中间层连接优化，通过多分辨率反卷积滤波器生成输出，在公开数据集上取得了优异的成果。

    Apr, 2018

  • 基于 MIScnn 框架的乳腺癌核分割及分析

    使用 NuCLS 数据库创建了多评估者模型来自动化分析乳腺癌中的细胞核，该模型采用了 MIScnn 框架中广泛采用的 U-Net 方法，并进行了预处理和数据探索。使用多种评估指标对最终模型进行了测试，并与 NuCLS 研究结果进行了比较和解释，给出了今后细胞核模型发展的重要指示。

    Jun, 2022

  • 基于实例感知的无监督核分割学习

    本文提出了一种自监督学习框架，通过对卷积神经网络进行尺度三元组学习和数量排序等两个子任务，隐式地利用细胞核大小和数量的先验知识，从原始数据中挖掘出特征表示，最终在公开数据集上取得了非常好的结果，大大提高了细胞核实例分割的准确性。

    Jul, 2020

  • 使用点注释进行细胞核分割的伪边缘网络

    本文提出了一种较少注释的、基于点的核分割方法，引入了一种叫做 PseudoEdgeNet 的辅助网络，可以引导分割网络识别核边缘，提高整个系统的性能。实验表明，在两个公共数据集上，该方法始终优于其他弱监督方法。

    Jun, 2019

  • 利用组织病理图像中的部分点注释进行弱监督深度细胞核分割

    本文提出了一种基于部分点注释的弱监督分割框架，其中包括两个阶段的半监督策略和深度神经网络的使用，使得核分割的自动化处理不需要大量的标注数据和额外的计算负担。

    Jul, 2020

  • 数字癌症组织的多器官细胞核同时语义分割、实例分割和分类的自底向上三合一框架

    通过引入附加的解码器头部使用独立的加权损失函数，该研究提出了对数字组织学中核的同时实例分割和分类的多阶段方法，以在高质量实例分割和核分类方面取得了显著的性能改进，并且在 19 种类型的组织上具有广泛的适用性和较低的复杂性。

    Aug, 2023

  • Cyto R-CNN 和 CytoNuke 数据集：朝着亮场组织学图像的可靠整个细胞分割

    我们提出的新的 Cyto R-CNN 架构在整个细胞分割方面优于现有算法，同时提供比任何其他模型更可靠的细胞测量，这可能改善数字病理学工作流程，进而提高诊断水平。此外，我们发布的数据集可以用于未来的模型开发。

    Jan, 2024

  • 无监督高吞吐量定量位相图像中细胞和细胞核的分割

    建议使用无人值守的多阶段分割方法进行细胞核的自动、快速、无监督分割，并利用该方法的定量相位信息来介绍新的细胞质和细胞核特征，以提高细胞学诊断的可行性和可解释性。

    Nov, 2023