Aug, 2020
PIGNet: 基于物理知识的深度学习模型，用于广义药物靶点相互作用预测
PIGNet: A physics-informed deep learning model toward generalized drug-target interaction predictions
Seokhyun Moon, Wonho Zhung, Soojung Yang, Jaechang Lim, Woo Youn Kim
TL;DR本研究提出通过预测物理信息方程中的原子间相互作用并将其总和用于蛋白质 - 配体复合物的结合亲和力，以增强深度神经网络（DNN）药物靶标交互模型的泛化能力，并通过扩大训练数据的结合位姿和配体来改进模型的泛化能力物。通过可视化配体亚结构的贡献，这种物理信息策略为进一步配体优化提供了见解。我们的模型 PIGNet 在 CASF2016 比较评估中得到验证，表现出优于以前方法的对接和筛选能力。