KDDJul, 2021
在明确的因果假设下评估真实世界基因分型数据预测抗菌药物耐受性的潜在偏见
Assessing putative bias in prediction of anti-microbial resistance from real-world genotyping data under explicit causal assumptions
Mattia Prosperi, Simone Marini, Christina Boucher, Jiang Bian
TL;DR该研究针对细菌基因型 - 表型抗菌药物抵抗性数据进行试验，使用倾向性平衡和混杂变量调整方法处理非随机抽样带来的偏倚，采用提升的逻辑回归和随机森林模型，对抗菌药物抵抗性的预测性能进行评估。结果表明在采样非随机、基因特征与抗药性之间存在关联时，使用该方法可优化预测模型。