自底向上综合规划和可合成分子设计的摊销树生成
基于生成模型的分子生成模型在药物发现方面取得了突破。通过使用具有化学验证的反应和反应物的动作空间,SynFlowNet 模型能够构建具有合成可行性的新分子,并且在多样性和高效性方面表现出色。
May, 2024
本文提出了一种名为 MCTS 的基于模拟退火算法的反合成规划方法,使用 Experience Guidance Network 从化学合成经验中学习知识,实现有效处理拥有巨大可能性的化学反应,实验结果证明在效率和功效上均优于现有研究成果。
Dec, 2021
通过条件残差能量模型,提出了一种通用的、以质量为导向的分子合成路线生成框架,该框架可以增强各种策略生成的最可能合成路线的质量并在性能上优于先前的最先进方法 2.5%。
Jun, 2024
本篇论文提出了一种新的分子生成模型,模拟了现实中的制备过程,可以通过选择初试反应物(从商业上可获得的分子池中选择),使用反应模型来预测它们之间的反应生成新的分子,同时可以考虑化合物的性质和合成路径的可行性,通过解决反合成问题,预测出一组可以产生目标产品的反应物。
Jun, 2019
提出了一种基于图形搜索的策略,消除了中间分子的冗余探索,并采用图神经网络引导搜索。同时,我们的方法可以同时搜索一批目标,并使用基于树的搜索方法删除树间重复。在两个数据集上的实验结果表明了我们方法的有效性。特别是在广泛使用的 USPTO 基准测试中,我们将搜索成功率提高到 99.47%,提高了 2.6 个百分点的先前最先进的性能。
Jun, 2022
研究者利用深度神经网络和 Monte Carlo Tree Search 相结合的方法,通过训练为所有有机化学反应提供未来的化合物转化路径,从而加速了药物和材料的发现,并启用完全自动的机器人合成。
Aug, 2017
该研究提出了一种基于 Transformer 的自动回流合成路径规划模型,能够从受体预测开始,通过蒙特卡罗树搜索实现自动化回溯合成路径规划,经过两个数据集训练之后,其表现为单步回流合成预测的最佳,达到了 54.6%和 63.0%的准确性,尤其是其能够成功地进行多步回流合成路径规划,提供了全新的自动化回流合成规划策略。
May, 2019