Jan, 2022

D-Former: 一种用于 3D 医学图像分割的 U 形扩张 Transformer

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TL;DR本文提出了一种称为 Dilated Transformer 的方法，该方法在全球和局部范围内交替捕捉成对的补丁关系进行自我关注。我们基于 Dilated Transformer 的设计构建了一种名为 D-Former 的 U 型编码器 - 解码器分层结构，用于 3D 医学图像分割。实验表明，我们的 D-Former 模型在低计算成本下，从头开始训练，优于各种有竞争力的基于 CNN 或 Transformer 的分割模型。
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发现论文，激发创造
  • 3D TransUNet：通过视觉 Transformer 提升医学图像分割

    通过在 2D TransUNet 体系结构的基础上建立在最先进 nnU-Net 体系结构的基础上，充分探索 Transformers 在编码器和解码器设计中的潜力，我们引入了两个关键组件：1）一个从卷积神经网络（CNN）特征图中令图像块标记化的 Transformer 编码器，从而实现全局上下文的提取；2）一个自适应地利用候选区域和 U-Net 特征之间的交叉注意力进行候选区域的精炼的 Transformer 解码器。我们的研究发现，不同的医学任务受益于不同的体系结构设计。Transformer 编码器在多器官分割中表现出色，其中器官之间的关系至关重要。另一方面，Transformer 解码器在处理小而具有挑战性的分割目标（如肿瘤分割）方面更有益处。大量实验证明了将基于 Transformer 的编码器和解码器集成到 U 型医学图像分割体系结构中的巨大潜力。TransUNet 在各种医学应用中超越竞争对手。

    Oct, 2023

  • nnFormer: 交错 Transformer 用于体积分割

    介绍了一种新的医学图像分割模型 ——nnFormer，利用了 3D Transformer 模型的自注意机制，相比之前的 Transformer 模型在三个公开数据集上都取得了更好的性能。

    Sep, 2021

  • HiFormer: 使用 Transformer 实现的分层多尺度表示，用于医学图像分割

    本文提出了一种新的方法 HiFormer，它通过使用 Swin Transformer 模块和基于 CNN 的编码器设计了两种多尺度特征表示来有效地跨越 CNN 和 Transformer 进行医学图像分割。在编码器解码器结构的跳跃连接中，我们提出了 Double-Level Fusion（DLF）模块，以确保从两个上述表示中获得的全局和局部特征的细粒度融合。在各种医学图像分割数据集上的广泛实验表明，HiFormer 在计算复杂度、定量和定性结果方面优于其他基于 CNN、Transformer 和混合方法。

    Jul, 2022

  • Dilated-UNet：一种使用扩张变换器和 U-Net 结构的快速准确的医学图像分割方法

    介绍了 Dilated-UNet，结合了 Dilated Transformer 块和 U-Net 架构，用于快速准确地进行医学图像分割，并在多个具有挑战性的医学图像分割数据集上取得了优于其他模型的成果。

    Apr, 2023

  • SegFormer3D: 3D 医学图像分割的高效 Transformer

    SegFormer3D 是一种记忆高效的分层 Transformer，在 3D 医学图像分割中拥有比当前最先进模型更少的参数和更低的 GFLOPS，并在 Synapse、BRaTs 和 ACDC 等广泛使用的数据集上取得竞争性结果。

    Apr, 2024

  • UNetFormer: 用于三维医学图像分割的统一视觉 Transformer 模型和预训练框架

    本文提出了一个统一的框架，它由两个体系结构组成，称为 UNetFormer，具有基于 3D Swin 变压器的编码器和卷积神经网络和变压器的解码器。该架构的设计允许在准确性和计算成本之间满足宽范围的权衡要求。使用 CT 图像进行自我监督预训练，使用 Medical Segmentation Decathlon（MSD）数据集进行肝和肝肿瘤分割任务的 Fine-tune 和测试，并使用 MRI 图像的 BraTS 21 数据集进行脑肿瘤分割，并在 Dice 评分方面优于其他方法。

    Apr, 2022

  • ConvFormer: 提升医学图像分割的即插即用卷积神经网络模型

    通过构建 CNN 式 Transformer（ConvFormer）来提升更好的注意力收敛，从而获得更好的分割性能。

    Sep, 2023

  • AFTer-UNet：医学图像分割轴向融合 Transformer UNet

    本篇论文提出了一种名为 Axial Fusion Transformer UNet (AFTer-UNet) 的方法，它结合了卷积层和 Transformer 的优势，同时考虑了切片内和切片间的长距离信息，在医学图像分割中优于现有技术。

    Oct, 2021

  • 金字塔医疗转换器用于医学图像分割

    通过应用金字塔形网络结构、多尺度注意力和 CNN 特征提取，我们提出了一种称为金字塔医疗变压器（PMTrans）的新型方法，可以更好地处理医学图像分割任务。在三个医学图像数据集上的实验结果表明，PMTrans 相较于最新的基于 CNN 和变压器的模型，具有更好的性能。

    Apr, 2021

  • UNETR: 用于 3D 医学图像分割的变压器

    本篇论文介绍了一种新的 UNETR 架构，通过使用 Transformer 作为编码器，可以捕捉更长程的空间依赖性，同时保持 “U 形” 的网络设计。实验证明，在多个数据集上，该方法在多器官分割任务上取得了最新的最优性能。

    Mar, 2021