Mar, 2022
几何结构预训练下的蛋白表征学习
Protein Representation Learning by Geometric Structure Pretraining
Zuobai Zhang, Minghao Xu, Arian Jamasb, Vijil Chenthamarakshan, Aurelie Lozano...
TL;DR本文提出了利用 3D 蛋白结构进行预训练的蛋白质表示方法,并通过多视图对比学习和自我预测任务,实现了对蛋白质的编码。实验结果表明,该方法不仅可以比现有的基于序列的方法更有效地预测蛋白质的功能和褶叠分类,而且使用的预训练数据更少。