Apr, 2022

用于患者表征的深度规范化嵌入

PDF
TL;DR本文介绍了一种新的对比表示学习目标和训练方案，针对临床时间序列。该方法能将高维的医疗记录数据投影到低维的封闭单位球上，以编码几何先验，从而学习患者的死亡风险和器官功能，该方法可用于在线患者监测，并可提供临床医生的决策支持和改进下游机器学习任务的性能。
clinical time seriesrepresentation learningmortality riskorgan failureonline patient monitoring
发现论文，激发创造
  • 基于医学概念嵌入的深度架构衡量病人相似度

    本文提出了一个基于纵向病人电子健康记录 EHR 的病人相似性评估框架，结合卷积神经网络和医疗概念嵌入实现对病人临床记录的最优表示，进而提高了病人相似性的性能。

    Feb, 2019

  • 基于临床记录抽取的不同表征模型评估死亡率预测

    本研究基于 Transformers 预训练的语言表示学习方法，将特定医学记录中的信息提取，映射到标准词汇中，并在医院死亡预测任务中测试不同输入格式的性能，结果表明使用提取的唯一概念和标准名称作为输入可以获得更好的性能。

    Jul, 2022

  • 利用医疗概念丰富无监督用户嵌入

    本研究提出了一种概念感知的无监督用户嵌入方法，结合来自 MIMIC-III 和 Diabetes 两个临床语料库的文本文档和医学概念，用于疾病诊断和病人特征研究等领域，实验证明该方法的性能明显优于现有的无监督方法。

    Mar, 2022

  • 患者风险进展建模的时间监督对比学习

    我们提出了一种监督对比学习框架，通过学习每个时间步长的患者时间序列的嵌入表示来预测患者在随着观察到更多患者数据的过程中感兴趣结果的可能性变化。我们的方法在预测败血症患者的死亡率（MIMIC-III 数据集）和追踪认知障碍的进展（ADNI 数据集）方面优于现有的基准方法，并且在实验中始终能够正确恢复合成数据集的嵌入结构。

    Dec, 2023

  • 临床特征嵌入的语言模型训练范式

    通过自我监督训练模型来学习高质量的临床特征嵌入表示，以增强临床时间序列的表示学习能力，并通过无监督降维技术可视化学习到的嵌入表示，发现其与先前的临床知识具有高度一致性；同时在 MIMIC-III 基准数据上评估模型性能，并证明了使用临床特征嵌入的有效性。

    Nov, 2023

  • 癌症中心患者实验室检测代码嵌入表示的评估

    通过对 80000 名癌症中心病人的电子病历中的 LOINC 代码进行 Word2Vec 和 GloVe 的嵌入表示训练，研究了实验室检测结果在电子健康档案中的重要作用及其对死亡预测的影响，同时探讨了等级性属性的保留问题。

    Jul, 2019

  • TAPER：基于时间的病人电子病历表示

    应用 Transformer 网络和 BERT 语言模型，将包含多种数据模式的电子病历编入一个统一矢量表示，从而实现了病人就诊数据的高效表示，这种方法在 MIMIC-III ICU 数据集上得到了出色的性能和可泛化性。

    Aug, 2019

  • 医学术语嵌入的分层预训练

    这篇论文介绍了利用自然语言处理和表示学习生成医学术语的嵌入，以更好的预测临床决策和患者轨迹，提出了一个新的医学术语表示模型 HiPrBERT，并使用层次结构数据来训练和提高嵌入效果。

    Jul, 2023

  • DeepEnroll: 利用深度嵌入和蕴含预测的患者试验匹配

    DeepEnroll 是一种跨模态推理学习模型，通过在共享潜在空间中联合对招募标准和病人记录进行编码，以进行匹配推理，并通过数字信息嵌入和蕴含模块来进行推理。在真实世界的数据集上，DeepEnroll 表现优异，平均 F1 分数比最佳基线高 12.4%。

    Jan, 2020

  • 将复杂性嵌入数据表示而非模型：异质医学数据案例研究

    本文提出使用语义嵌入方法，将原始、杂乱的临床数据直接与下游学习架构耦合，以实现最小化预处理。我们从捕捉和编码数据表示中的复杂数据依赖性的角度考虑这一步骤，而不是在模型中实现，该方法允许使用快速，轻量级和简单的模型进行下游处理，对于没有机器学习专业知识的研究人员非常有用。我们通过三个典型的临床预测任务证明了高度压缩的嵌入数据表示捕获了大量有用的复杂性，尽管在某些情况下，压缩并非完全无损。

    Feb, 2018