BrainGB: 基于图神经网络的脑网络分析基准
本研究提出了一种针对大规模脑网络数据的 GNN 预训练框架 PTGB,能在没有特定任务标签的情况下学习脑网络的内在结构,并易于适应各种下游任务,从而实现对脑网络结构复杂性的自适应处理及临床神经疾病诊断的快速准确。
May, 2023
本文提出了一个名为 BN-GNN 的新型脑网络表示框架,使用深度强化学习技术训练元策略以自动确定给定脑网络所需的最优特征聚合数量(反映在 GNN 层数中),并在八个现实世界脑网络数据集上进行了广泛实验。结果显示,相对于传统 GNN,在不同的脑网络分析任务上,BN-GNN 对性能的提升更加显著。
Mar, 2022
探索人脑的复杂结构对于了解其功能和诊断脑部疾病至关重要。最近通过将人脑建模为具有图结构的模式来研究,其中不同的脑区表示为节点,这些区域之间的功能关系表示为边。此外,图神经网络(GNNs)在挖掘图结构数据方面显示出明显优势。近来,开发用于脑部疾病分析的 GNNs 进行脑图表示学习已引起越来越多的关注。然而,目前缺乏对该领域中当前研究方法的系统调查。本文旨在通过回顾利用 GNNs 进行脑图学习的研究工作来填补这一空白。我们首先介绍基于常见神经影像数据的脑图建模过程。随后,我们根据生成的脑图类型和目标研究问题对目前的工作进行系统分类。为了使这项研究能够为更广泛的研究人员群体所用,我们概述了代表性的方法和常用数据集,并提供其实施源。最后,我们对未来研究方向给出了我们的见解。该调查的存储库可访问 https://github.com/XuexiongLuoMQ/Awesome-Brain-Graph-Learning-with-GNNs。
Jun, 2024
该研究提出了一个可解释性的框架,用于分析特定于疾病的感兴趣区域和突出连接。该框架包括一个面向脑网络的预测模型和一个全局共享的解释生成器,该生成器突出了特定于疾病的生物标记物。实验证明,该框架可以获得出色的性能并识别有意义的生物标记物。
Jun, 2022
介绍了一种名为 NeuroGraph 的开源 Python 软件包,它包含了一系列基于图形的神经影像数据集以及基准的实现、模型训练和标准评估,可以用于机器学习研究高维功能性神经影像数据的分析和预测。
Jun, 2023
我们提出了一种基于多视图 GNN 和对比学习的方法,用于对多模态脑网络进行分析,并通过在两个现实疾病数据集上的实验证明了该方法的有效性。
Jul, 2021
本文介绍了 Graph Neural Networks (GNNs) 领域关于基准测试框架的应用,通过该框架,可对模型进行比较,并且探索新的 GNN 设计和洞见,其中,图形位置编码 (PE) 是该基准测试框架中引入的重要设计之一。
Mar, 2020
FBNETGEN 是一种通过深度大脑网络生成的任务感知和可解释的 fMRI 分析框架,旨在完全发挥深度图神经网络在基于网络的 fMRI 分析中的作用,并提供了通过突出预测相关的大脑区域进行独特解释的学习图。
May, 2022
本研究提出了 Bargrain,它通过使用图卷积网络模拟了两种图结构:过滤后的相关矩阵和最优样本图,旨在既得益于这两种图结构,又解决了仅依赖单一结构的限制。大量实验证明,Bargrain 在脑部疾病数据集的分类任务中,以平均 F1 分数为衡量指标,胜过了现有方法。
Dec, 2023
通过模型解释技术,本文综述了图神经网络在功能磁共振成像数据集上应用于疾病预测任务中的应用,特别关注所生成的神经变性疾病和神经精神障碍的潜在生物标记的稳健性,并建议建立新的标准来评估这些潜在生物标记的稳健性。
May, 2024