Jul, 2022
癌症生物信息学深度学习模型的系统评估：癌症数据编码和解释的基本趋势
A systematic review of biologically-informed deep learning models for cancer: fundamental trends for encoding and interpreting oncology data
Magdalena Wysocka, Oskar Wysocki, Marie Zufferey, Dónal Landers, André Freitas
TL;DR对 42 篇研究进行了系统综述，旨在讨论深度学习模型如何支持癌症生物学的推理，并重点关注多组学分析。我们介绍了一种称为生物中心可解释性的概念，并根据其分类方法讨论了在这些模型中整合领域先验知识的表征方法。分析表明，编码先验知识和改进解释性之间存在趋同性，这是深度学习模型形式化生物解释性和发展不那么特定于问题或应用的方法的重要一步。