Nov, 2022

sEHR-CE: 结构化电子病历语言建模，用于高效和可推广的患者队列扩展

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TL;DR本文提出了一种基于 Transformers 的新型框架 sEHR-CE，可以在不需要映射的情况下，对异构临床数据集进行集成表型和分析。使用预训练的语言模型来预测疾病表型的准确性高于非文本和单个术语方法，并且用 2 型糖尿病为例说明如何识别没有诊断但具有与患者相似临床特征的个体。
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发现论文，激发创造
  • 电子健康记录与笔记的多模态融合：利用超图和 LLM 集成结构与语义

    提出了一个名为 MINGLE 的新框架，通过融合结构和语义以有效地整合不同类型的 EHR 数据，从而提高预测性能。

    Feb, 2024

  • 电子健康记录的多模态分析上的对比学习

    该研究提出了一种新颖的多模态特征嵌入生成模型，并设计了一种多模态对比损失函数，通过联合分析结构化和非结构化数据的两种重要模态来捕获患者的完整病历，从而实现多模态电子健康记录特征表示学习并保护隐私。模拟研究结果表明，所提出的算法适用于多种配置，并且进一步验证了该算法在真实世界电子健康记录数据中的临床应用。

    Mar, 2024

  • 基于医疗码为中心的多模态对比电子健康记录建模的层次正则化下次就诊诊断预测

    使用电子病历（EHR）来预测下次就诊诊断是医疗保健中的重要任务，为医疗服务提供者和患者制定主动的未来计划至关重要。然而，许多先前的研究没有充分解决 EHR 数据中固有的异质性和分层特征，不可避免地导致次优性能。为此，我们提出了 NECHO，一种新颖的以医学代码为中心的多模态对比 EHR 学习框架，具备分层正规化。首先，我们使用定制的网络设计和一对双模态对比损失来整合包括医学代码、人口统计和临床记录在内的多方面信息，这些信息都围绕着医学代码表示。我们还使用医学本体中的父级信息对特定于模态的编码器进行正规化，以学习 EHR 数据的层次结构。对 MIMIC-III 数据进行的一系列实验证明了我们方法的有效性。

    Jan, 2024

  • EHRmonize: 使用大型语言模型从电子病例中抽取医学概念的框架

    EHRmonize 利用大型语言模型从电子健康档案中提取医疗概念，具有提高效率、减少标注时间的潜力，但仍需要临床专业医生的监督。该框架可作为一个 Python 包提供，有望加速健康研究和改善数据整合过程。

    Jun, 2024

  • 改进上下文化神经语言模型的临床笔记表型描述

    通过对临床记录进行语义学分析，可以帮助精确地提取出患者的病情，进而为医疗决策和医疗档案二次利用提供支持；本研究探索了几种基于 BERT 模型的病情提取机制，避免了传统的手工规则的繁琐操作，实验结果表明这种机制在病情识别上具有较高的性能，可适用于医学领域的实际应用。

    Oct, 2019

  • 利用语言模型进行临床风险预测：益处与考虑因素

    利用语言模型（LMs）来代表结构化电子健康记录（EHRs），例如诊断历史，可以在各种风险预测任务中提高性能，同时具有少样本学习、处理未知医学概念和适应各种医学词汇等优势，但在使用这些模型时需要谨慎

    Nov, 2023

  • 支持医生研究活动的电子健康记录中疾病数据提取的系统建模

    利用电子病历数据进行研究活动，本研究旨在解决数据标准化问题，通过数据预处理、注释和转换等步骤将数据转化为标准格式，使用机器学习模型识别疾病并将其转化为 ICD-10 编码，该模型的准确率达到 81%、优于 MetaMap 的准确率 67%。

    Apr, 2024

  • PheME: 一种深度集成框架，用于改进来自多模态数据的表型预测

    本文提出了 PheME 这一基于多模态数据应用深度神经网络和模型融合技术的方法来准确地从电子病历中提取表型信息，以改善表型预测的性能。经过实验验证，PheME 方法在使用多模态数据的情况下，在七种疾病的表型预测中都获得了显著的提高。

    Mar, 2023

  • 如何利用多模态电子病历数据进行更好的医学预测？

    本文提出了一种从医疗电子健康系统中提取伴随临床记录的方法，并使用这些数据综合研究了不同模型和数据利用方法对于更好的医疗任务预测的影响。结果表明，我们的融合模型优于不包含临床记录的最新方法，这证明了我们的融合方法的重要性和临床注意点特征的价值。

    Oct, 2021

  • 基于语义分解技术的大型语言模型在电子健康记录数据上的学习改进

    本文介绍了 H-BERT，该模型采用完整的图树扩展表示 EHR 中的医疗编码，提高了病患归属感的预测，并创建了相关但临床不同表型的患者的不同表示。

    Nov, 2022