Apr, 2023

Slideflow: 实时全切片可视化的数字病理学深度学习

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TL;DRSlideflow 是一种灵活的深度学习库，支持数字病理学的广泛深度学习方法，并包括快速的整个幻灯片接口来部署已训练好的模型，同时也具有高度优化的整个幻灯片图像处理等特点。
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发现论文，激发创造
  • 基于深度学习的全切片图像分割与分析通用框架

    本文章基于深度学习方法提出了一种可用于组织病理学图像分析的框架，并在癌症诊断、预后和图像分析等方面取得了良好的效果。

    Jan, 2020

  • 全切片图像分析的深度学习：概述

    本文综述了使用整张切片图像训练深度神经网络的方法，并强调了这些方法背后不同的思想，以期解决整张切片图像所面临的挑战。

    Oct, 2019

  • 基于深度强化学习的全切片病理图片快速诊断框架

    提出了一种基于弱监督深度强化学习框架的深度神经网络方法，可以快速有效地进行数字病理学领域中含有丰富组织特征信息的高分辨率全幅病理图像分析，而不需要基于像素级别的像素注释数据集。

    May, 2022

  • 超越多实例学习：全分辨率全内存端到端病理切片建模

    人工智能（AI）在大规模数字化临床数据集上训练系统以提高健康结果方面具有巨大潜力。计算病理学作为对诊断和生物标志物具有重大影响的大量显微镜图像数据，处于这一发展的前沿。百亿像素病理学切片由于其巨大的尺寸而面临独特挑战，通常被分成数万个较小的瓷砖进行分析。我们提出了一种新方法，通过在内存中全面高分辨率地同时训练瓷砖编码器和整个切片聚合器来解决这个问题，弥合了输入和切片级监督之间的差距。虽然计算成本更高，但详细的定量验证显示了病理基础模型的大规模预训练的前景。

    Mar, 2024

  • 基于自对比的半监督学习框架用于预后预测的全切片图像

    应用深度学习技术分析组织病理图片对于自动预后预测的重要性进行了创新性研究，提出了一个新颖的三部分框架，包括基于卷积网络的组织分割算法、对比学习模块和嵌套多示例学习分类模块。在人工生成的数据和简单的诊断任务上进行了初步验证，并在膀胱癌的预后预测任务中取得了显著的成果，模型的 AUC 分别达到 0.721 和 0.678。

    May, 2024

  • Virchow：百万切片数字病理基础模型

    使用自监督学习方法，创建了 Virchow 计算病理学的 632 百万参数深度神经网络基础模型，以解决病理学任务中缺乏数据的挑战，并在病理图像分类、癌症检测和亚型、生物标志物预测等多个任务中表现出色，显示了预训练在病理学图像数据集上的重要性和潜力。

    Sep, 2023

  • 计算组织病理学的深度神经网络模型：一项调查

    本文对如何使用深度学习应对肿瘤组织病理图片的问题进行了综述和分析，从 130 多篇研究论文中选出机器学习策略、生存模型、现有数据集和研究中存在的挑战和限制等方面进行总结和梳理。

    Dec, 2019

  • 为低资源环境重新思考组织学切片数字化工作流程

    本研究提出了一种新的云数字切片工作流，通过上传低质量视频从廉价且便宜的显微镜中获取整张扫描仪质量的全切片图像（WSIs）。

    May, 2024

  • 病理学中的 TB 级深度多实例学习用于分类和定位

    该研究使用大规模的有标签数据集训练深度学习模型结合 “多示例学习”，以在针生物镜下进行前列腺癌诊断，并获得了很高的 AUC，为计算病理学领域的决策支持系统部署提供了基础。

    May, 2018

  • 仅使用全局标签的组织病理分类和疾病定位：一种弱监督方法

    提出了一种在弱监督学习下用于疾病定位的方法，使用预训练的深度卷积网络、特征嵌入、以及基于多实例学习的顶部实例和负面证据学习等技术，即使在没有像素级别注释的情况下，仅通过图像级标签进行训练也能够展现出与强监督学习相当的性能。

    Feb, 2018