Apr, 2023

hist2RNA：由乳腺癌组织病理学图像预测基因表达的有效深度学习架构

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TL;DR利用数字组织病理学图像和深度学习，通过一个新的计算方法 (hist2RNA) 来预测含有 138 个基因的新型分子表型检测结果，包括腺激素受体阳性的乳腺癌亚型，并能为患者的术后治疗提供良好预测。
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发现论文，激发创造
  • 从组织病理学图像预测分子表型：乳腺癌中一项转录组范围的表达形态分析

    该研究使用基因特定模型和卷积神经网络从组织形态结构预测肿瘤基因表达及其空间分布，并验证了该方法在乳腺癌中的可行性，为描述肿瘤内异质性提供了可扩展性的方法。

    Sep, 2020

  • 基于深度学习的乳腺癌肿瘤和免疫表型的组织病理预测

    通过应用多实例学习算法和不同的特征提取方法，该研究对乳腺癌的初级肿瘤进行多重描述，以测量肿瘤和免疫表型，为开发计算病理学标志物提供了潜力。

    Apr, 2024

  • 利用 H&E 染色组织图像预测早期乳腺癌复发风险

    通过分析病理学图像预测乳腺癌早期患者复发的风险，本研究探讨了深度学习算法是否能准确预测复发的可能性，结果显示通过对 125 个组织切片图像进行分析，得到了对低、中、高风险预测的灵敏度分别为 0.857、0.746 和 0.529，对应的特异性分别为 0.816、0.803 和 0.972，而与专家病理学家提供的组织级别信息对比，得到的皮尔逊相关系数为 0.61，此外，模型通过类活化图考虑了管状形成和有丝分裂率对不同风险组的预测结构。

    Jun, 2024

  • DeepCancer：基于深度生成式学习通过基因表达检测癌症

    该研究提出了一种深度生成式机器学习架构（称为 DeepCancer），通过对未标记的微阵列数据进行特征学习，帮助对癌症进行诊断。该模型在两个不同的临床数据集上进行了测试，并证明了其精确度较高，可显著控制假阳性和假阴性评分。

    Dec, 2016

  • 使用深度学习技术预测肺组织活检图像的 EGFR 突变

    本文通过深度学习图像分析技术，使用自定义深度学习管道在肺癌组织中识别 EGFR 突变的形态学相关性，同时检测肿瘤和组织学亚型，证明了这种方法的有效性，并指出了使用特征提取器层在目标数据集上进行微调时没有特殊优势，选择高细胞密度区域并不总是有帮助。

    Aug, 2022

  • 全自动基于深度学习的免疫组织化学报告算法的开发与验证

    使用基于深度学习的半监督训练的全自动决策支持系统 (DSS)，对浸润性导管癌进行免疫组化评分，从而提高免疫组化评分的准确性和治疗决策，特别是在专家不可用的情况下。

    Jun, 2024

  • 通过多视图图形对比学习与 HSIC 瓶颈正则化从组织学中预测空间分辨率基因表达

    通过多视图图对比学习和 HSIC 约束正规化方法构建的空间转录组学 (ST) 框架 (ST-GCHB)，以学习共享表示来考虑空间依赖性，从而根据查询的图像点来估计相应的基因表达量。

    Jun, 2024

  • 通过双模式对比学习从 H&E 组织学图像中空间预测基因表达

    该研究提出一种生物模态嵌入框架 Bi-modaL Embedding for Expression Prediction (BLEEP)，可以生成整张组织学图像中的基因表达文件，以此代替传统的时间与金钱代价高昂的基因表达分析方式进行医学诊断和研究。

    Jun, 2023

  • 利用深度学习和金字塔采样进行乳腺癌图像中的自动 HER2 评分

    使用深度学习方法对免疫组织化学染色的乳腺癌组织图像进行 HER2 状态自动分类，以提高诊断准确性和评估速度，对乳腺癌的治疗规划可能产生重大影响。

    Apr, 2024

  • 利用组织病理学图像基于深度学习的多种癌症生存预测

    通过开发深度学习系统，在多种癌症类型中利用组织病理图像预测疾病特异性生存，为癌症治疗和监测提供重要的预后信息。

    Dec, 2019