Apr, 2023

FineEHR: 优化临床记录表示以提高死亡率预测

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TL;DR本文提出了 FINEEHR 系统，采用度量学习和微调等两种表示学习技术来优化临床记录的嵌入，以提高预测准确性。使用 MIMIC III 数据集评估 FINEEHR 的表现，结果表明两种嵌入优化方法均能提高预测准确性，同时它们的组合给出了最好的结果，平均 AUC 为 96.04％，平均 AUC-PR 为 96.48％。
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发现论文，激发创造
  • 多模态转换器：将临床记录与结构化电子病历数据融合，可解释的住院死亡率预测

    本论文提出一个新型的多模态变压器，用于融合医疗记录数据和医生的述职记录来预测住院死亡率，并使用可视化方法展示关键的医疗记录和医疗数据特征，进而提高了诊断的可解释性和预测的精度。

    Aug, 2022

  • 可扩展和准确的电子健康记录深度学习

    使用电子健康记录进行循证医学和准确预测，通过 Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) 格式表示病人的原始病历记录，并使用深度学习方法进行多中心的多个医疗事件预测，包括住院死亡率、未经计划的 30 天再入院率、医院停留时间延长、所有患者的最终出院诊断等。

    Jan, 2018

  • 如何利用多模态电子病历数据进行更好的医学预测？

    本文提出了一种从医疗电子健康系统中提取伴随临床记录的方法，并使用这些数据综合研究了不同模型和数据利用方法对于更好的医疗任务预测的影响。结果表明，我们的融合模型优于不包含临床记录的最新方法，这证明了我们的融合方法的重要性和临床注意点特征的价值。

    Oct, 2021

  • 电子健康记录笔记的动态信息检索的机器学习概念化

    通过利用电子病历审计日志，我们的工作在特定的临床背景和特定时间点上，将机器学习作为便签相关性的监督源进行概念化，以降低临床医生在记录过程中查找相关病史所需的努力。我们的评估集中在急诊部动态检索，这是一个具有独特信息检索和记录编写模式的高急症设置。我们展示了我们的方法在预测哪些便签将在个人记录会话中被阅读方面可以达到 0.963 的 AUC。此外，我们对数名临床医生进行了用户研究，发现我们的框架可以帮助临床医生更有效地检索相关信息。在这个要求高的环境中展示我们的框架和方法表现良好是一个有希望的概念验证，表明它们将适用于其他临床设置和数据模态（例如实验室、药物、影像）。

    Aug, 2023

  • 基于临床记录抽取的不同表征模型评估死亡率预测

    本研究基于 Transformers 预训练的语言表示学习方法，将特定医学记录中的信息提取，映射到标准词汇中，并在医院死亡预测任务中测试不同输入格式的性能，结果表明使用提取的唯一概念和标准名称作为输入可以获得更好的性能。

    Jul, 2022

  • 对预训练的摘要问答模型进行微调用于临床文档解析

    解释了一个系统，可以解析超声心动图报告并验证射血分数 (EF) 值，从而帮助确定适合加入远程患者监测项目的心力衰竭 (HF) 患者的资格。该系统通过在定制标记数据上进行微调，使用预训练的抽取问答 (extractive QA) 变换器模型，采用了在低资源环境中推广解决方案的方法，并最终通过在 MIMIC-IV-Note 等公共临床数据集上运行实验，帮助我们的临床医生自动完成规模任务，节省了超过 12 个月中超过 1500 小时的时间。

    Dec, 2023

  • 深度电子病历：利用医疗记录进行慢性病预测

    本文提出了一种结合了结构化信息和文本医疗笔记的通用多任务框架，用于预测疾病发病率。与传统的基于文本的预测模型相比，我们的方法不需要特定于疾病的特征工程，并且可以处理存在于文本中的否定和数值。在 100 万名患者的队列中，我们的模型表明使用文本的模型优于仅使用结构化数据的模型，并且能够使用文本中的数值和否定，进一步提高预测性能。此外，我们比较了医疗专业人员用于解释模型预测的不同可视化方法。

    Aug, 2018

  • 利用医学命名实体和多模态学习提高医院死亡率预测

    本研究旨在探究如何利用医疗自然语言处理技术，将临床文本与结构化临床数据相结合，建立多模态神经网络模型，实现对重症监护室患者住院死亡风险的预测。研究结果显示，相较于基准模型，本模型的 AUC 值提高了 2%。

    Nov, 2018

  • 利用语言模型预训练改进临床病历的层级病人分类

    提出了一种预先训练的层级循环神经网络模型，通过解析最小处理的临床记录，比传统方法更好地处理了医疗信息技术中的出院诊断分类任务，并应用归因技术来确定模型用于进行预测的单词以及其重要性。

    Sep, 2019

  • 临床时间序列数据的多任务学习和基准测试

    该研究提出了利用来自公开可用的激痛医学信息库（MIMIC-III）数据集的四个临床预测基准，旨在解决机器学习在医疗保健研究中缺乏公开可用基准数据集的问题。

    Mar, 2017