利用不确定性感知因果模型提高基于图像的精准医疗
本文研究了使用卷积神经网络(CNN)进行三维重建的不确定性建模的价值。通过采用每个补丁的异方差噪声模型和近似贝叶斯推理的参数不确定性,作者展示了这两者联合起来可以带来最先进的扩散MR脑图像三维重建性能。该方法的概率特性为超解析的输出提供了一种自然的量化不确定性的机制,并通过对健康和病态大脑的实验证明了这种不确定性的重要性。
May, 2017
研究探索了在深度神经网络中基于蒙特卡罗Dropout的多种不确定性估计方法,提供了四种不同的体素级别的不确定性度量,可用于医学图像中的病变检测和分割。经实验结果表明,使用不确定性度量能够比仅使用网络的Sigmoid输出作为概率选择更好的操作点。
Aug, 2018
研究在医学上,使用其他深度神经网络模型方法来捕捉模型的不确定性,以确定模型决策是否在个体患者上具有一定程度的可靠性,同样通过贝叶斯嵌入,RNN模型可以更有效地捕获模型的不确定性,研究分析模型不确定性受各种输入特征以及患者亚组的影响。
Jun, 2019
对于集成预测不确定性以提高深度学习患者安全性的图像分类器,我们评估了两种不同的方法。我们发现,这些方法使用光学相干断层扫描的数据集训练,能够得出更可靠的结果,有望提高患者安全性。
Aug, 2019
该综述回顾了现有的用于量化深度学习模型预测不确定性的方法,并着重关注了医学图像分析中特有的挑战、评估方案以及不确定性量化在医疗领域中的开放性挑战。
Oct, 2022
综合机器学习医疗模型在临床实践中的应用仍然不理想,缺乏证据证明其可靠性进而限制了其广泛应用。本文综述了用于各种医学图像任务中开发的机器学习模型的不确定性量化方法,包括概率和非概率方法,以全面调研与不确定性量化相关的研究。该综述对医学图像的分析和医学应用以及相应的不确定性评估协议进行了讨论,并强调了未来的研究方向。整体上,本综述旨在帮助临床和技术领域的研究人员快速而深入地了解医学图像分析机器学习模型中的不确定性量化研究。
Oct, 2023
该论文研究了自动化深度学习工具在多发性硬化症患者磁共振成像扫描中的白质病变分割中的不确定性量化作为其可靠性指标。研究探讨了不确定性在结构化输出分割任务中的两个主要方面,并提出了新的衡量不确定性的方法。通过分析来自多中心的MRI数据集,结果表明我们的方法能够更有效地捕捉模型在病变和患者尺度上的错误。
Nov, 2023
开发一种新颖的不确定性量化(UQ)框架,用于在缺乏实际数据的情况下估计患者生存模型的不确定性。通过基于1383名脑转移患者的数据集开发和评估我们的方法,我们的研究假设是推理过程中给定测试患者的事件发生时间更加确定,当其在训练集中与其他患者具有更高的特征空间相似性。因此,感兴趣患者的不确定性通过患者相似性排名和预测相似性排名的一致性指数来表示。通过与模型整体区分度指数相比,模型不确定性定义为最大不确定性约束下的增加百分比。我们在多个临床相关的终点变量上评估了我们的方法,包括颅内进展时间(ICP)、放疗后无进展生存时间(PFS)、总生存时间(OS),以及颅内进展时间和/或死亡时间(ICPD),应用了统计模型和非统计模型,如CoxPH、条件生存森林(CSF)和神经多任务线性回归(NMTLR)。我们的结果显示,所有模型在颅内进展时间(2.21%)上的不确定性最低,而在颅内进展时间和/或死亡时间(ICPD)(17.28%)上的不确定性最高。总体而言,OS模型的不确定性表现较高,其中NMTLR的不确定性最低(1.96%),而CSF的不确定性最高(14.29%)。综上所述,我们的方法可以估计个体患者生存模型的不确定性结果。正如预期的,我们的数据经验证明,通过我们的技术测量的模型不确定性的增加会导致特征空间与预测结果的相似性降低。
Nov, 2023
基于医学影像的个性化医学,可以准确预测未来个体化临床疾病进展和治疗反应,对于长期、复杂、异质性的无法治愈的疾病(如多发性硬化症(MS))的医疗和药物开发具有巨大影响。本文提出了第一个用于建模疾病进展的连续时间因果框架,利用神经随机微分方程(NSDE)。该因果推断模型以患者的高维影像(MRI)和表格数据为输入,预测潜空间中不同治疗的真实和反事实进展轨迹。NSDE允许估计高置信度的个性化轨迹和治疗效果。在多中心独家数据集上进行了大量实验,该数据集包括在多个随机临床试验中获得的患者3D MRI和临床数据。我们的结果展示了第一个基于不确定性的因果深度学习(DL)模型,可以准确预测未来患者的MS残疾发展(如EDSS)和治疗效果,利用基线MRI,并且可以发现在临床试验中没有达到临床终点的患者亚组,模型对他们的治疗反应具有高置信度。
Jun, 2024
本研究旨在解决自动化医疗图像分割中,由于检测错误而增加的质控工作量。通过利用准确性与不确定性(AvU)损失函数训练FlipOut模型,研究提出了一种新方法,使贝叶斯不确定性仅在不准确区域存在,从而有效减少了准确体素的误报。实验证明,该方法在降低准确区域不确定性的同时,保持了不准确区域的不确定性水平。
Sep, 2024