基于深度学习模型的模糊基因选择和癌症分类
基于深度学习的生存预测模型中的两种基因选择策略,一种利用稀疏性诱导方法,另一种利用重要性基因选择来识别相关基因,通过广泛的实验验证表明,该策略不仅可以识别具有高预测能力的基因特征用于生存结局,还可以简化低成本基因组筛查过程,为个体化医学和靶向癌症治疗的推进提供了一个可伸缩且有效的工具。
Mar, 2024
本文提出了一种利用自编码器和可解释的基于人工智能的评分来进行特征选择的算法,可用于诊断、预后和精准医疗。该算法在慢性淋巴细胞白血病数据集上应用,能够确定一组有意义的基因,供进一步医学研究参考。
Mar, 2023
该研究提出了一种深度生成式机器学习架构(称为 DeepCancer),通过对未标记的微阵列数据进行特征学习,帮助对癌症进行诊断。该模型在两个不同的临床数据集上进行了测试,并证明了其精确度较高,可显著控制假阳性和假阴性评分。
Dec, 2016
机器学习模型在表达基因数据的表型分类方面取得了好的性能,通过提取决策的解释,这些模型能提供对表型的理解,讨论了这种解释的生物学和方法论限制,并在癌症和健康组织样本的多个数据库上进行了实验。
Feb, 2024
本研究提出了一种新的方法,使用基因表达数据进行癌症分类问题的解决,首先运用信噪比算法筛选出非冗余基因的子集,然后运用多目标粒子群算法进行特征选择,并采用自适应 K 最近邻算法进行癌症分类,从而提高了癌症分类的准确性。
May, 2022
本文研究了利用下一代测序技术进行基因组测序以及使用机器学习模型预测 LoFtool 分数和基因突变的相关特性,通过建立多个模型并评估其性能,得到了测试集 r 平方值为 0.97 的结果。
Jan, 2024
本文在威斯康星州诊断性乳腺癌数据集上比较了六个机器学习算法的分类测试准确性,并测量了它们的灵敏度和特异性。实验结果表明,所有的算法都表现良好,并超过了 90% 的测试准确率,其中 MLP 算法表现最佳,测试准确率高达 99.04%。
Nov, 2017
本研究提出了一种利用背景生物网络信息来构建分类模型的端对端框架,应用于基因表达数据和生物网络来进行癌症预后预测,实验结果表明相比于深度神经网络模型,我们的模型取得了更高的准确性,并通过富集分析鉴定了多种癌症类型的贡献基因和通路,从中识别了已知的生物标志和新的生物标志候选物。
Jun, 2023
使用支持向量机和卷积神经网络两种机器学习模型,对文献进行分类并成功地实现对遗传突变与癌症风险及种群遗传变异的相关性进行预测,并提供新的临床决策支持工具。
Apr, 2019
该研究提出了一种新的方法,利用多项逻辑回归、非平滑非负矩阵分解 (nsNMF) 和支持向量机 (SVM) 等算法,从全序列数据中提取遗传信息以更好地预测癌症类型。实验表明,该方法在突变计数、突变得分等方面均表现优异,可用于其他疾病分类和通路发现研究。
Sep, 2018