Aug, 2023

砰然一声，文物消失了！苏木精和伊红染色活检标本中的快速文物去除和组织分割

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TL;DR使用 H&E Otsu 阈值化方法，快速检测整个切片图像中的组织并消除各种不良产物，如笔迹和扫描工。具。我们的方法通过获取低放大倍数的 RGB 概览图像的双峰表示，实现了简单的 Otsu 阈值化分离组织、背景和产物。我们在来自多个机构和数字扫描仪的切片图像上演示了我们的方法，每个图像都包含导致其他方法失败的大量产物。我们方法的优势在于其简单性：通过操作 RGB 颜色空间和使用 Otsu 阈值化，可以快速消除产物并分割组织。
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发现论文，激发创造
  • 组织横截面和笔记标记的图像分割

    我们开发了一个基于卷积神经网络的组织和笔迹分割模型，通过对 200 张 H&E 染色 WSI 数据集的训练，在组织分割和笔迹分割方面取得了较高的准确性。我们还提出了一种基于聚类的后处理方法，用于分离交叉部分，并证明该方法对于常见的玻片和扫描伪影具有鲁棒性。我们将经过训练的模型参数和后处理方法以 SlideSegmenter 的 Python 软件包公开发布。

    Jan, 2024

  • 采用 3D Epi - 模式定量相位成像和虚拟 H&E 染色的无标签和无玻片组织组织学

    该研究结合 3D 量化相位成像技术和非监督生成对抗网络管道，将未修改的厚组织的 qOBM 相位图像映射到类似于 H＆E 的 vH＆E 图像。这种有望显著节省肿瘤筛查、检测、治疗指导等时间、费用和人力的深度学习 qOBM 方法能够为组织病理学的新工作流程提供新的可能性。

    Jun, 2023

  • 利用全扫描图像进行自动诊断的组织伪影分割与严重程度分析

    提出了一种利用卷积神经网络的系统，结合了严重程度评估与伪影检测，通过使用 DoubleUNet 对伪影进行分割以及六个微调后的卷积神经网络模型来确定伪影的严重程度，该方法在伪影分割方面的准确性较当前技术领先水平提高了 9%，在伪影的严重程度评估方面与病理学家的评估结果具有 97% 的强相关性，而且该系统在异构数据集上表现出良好的鲁棒性，并且与自动分析系统集成后可以得到实际的应用性。

    Jan, 2024

  • 为计算病理学系统配备工件处理管线：计算和性能权衡的展示

    提出一种混合专家方案，用于从全玻片图像中检测五个显著的伪迹，其中包括受损组织、模糊、折叠组织、气泡和组织学上无关的血液，以提高计算病理学系统的可靠自动化诊断。

    Mar, 2024

  • 使用生成对抗神经网络进行前列腺活检 RGB 图像的计算组织染色和去染色

    该研究提出了两种新方法，使用条件生成式对抗网络进行机器学习，来实现对前列腺活检组织的计算机 H&E 染色和去染色，进而提高了组织结构等的相似性指数。

    Oct, 2018

  • 基于深度学习的将 H&E 染色转变为特殊染色

    本研究应用有监督学习的计算机染色转换技术，将经典的血红蛋白与嗜酸性染色（H&E）转换为肾脏穿刺活组织检测中的不同特殊染色，从而改善了多种非肿瘤性肾脏疾病的初步诊断质量，并减少了医疗系统和患者的时间和成本负担。

    Aug, 2020

  • 使用光子吸收遥感显微术进行无标记组织学的自动全层扫描成像

    利用第一代透射式光子吸收遥感显微镜的标签自由组织学平台，以及 pix2pix 实验，全面提高了组织学诊断的效率和疾病诊断的准确性，同时允许光学方法（标签自由的）与传统染色工艺进行对比，应用广泛。

    Apr, 2023

  • 通过显式伪像增强提高全尺寸图像质量控制

    本研究提出了一种方法，通过外部库生成和混合艺术品，从而增强给定的组织病理学数据集，以训练艺术品分类方法，从而解决了整个幻灯片图像获取中的伪影问题。

    Jun, 2024

  • 免疫组织化学生物标志物引导的组织病理学图像检索

    本研究提出了一种有针对性的图像搜索方法来改善肿瘤检测和癌症诊断。通过多种免疫组化染色技术，将图像合并生成复合标记物图像，并利用深度学习技术实现对癌变或异常组织信息的高效筛查，从而提高了搜索引擎的精确度。

    Apr, 2023

  • 为低资源环境重新思考组织学切片数字化工作流程

    本研究提出了一种新的云数字切片工作流，通过上传低质量视频从廉价且便宜的显微镜中获取整张扫描仪质量的全切片图像（WSIs）。

    May, 2024