通过微调 SAM 在少量示例上进行医学影像分割的低成本午餐
本文提出了一种称为 Med SAM Adapter 的方法,它通过将医学特定领域知识与分析模型进行简单而有效的适应技术的集成,将SAM模型的强分割能力扩展到医学图像分割,在多种图像模态下优化19项医学图像分割任务,并超过各种已有的基于医学图像分割的最新技术,并与全面优化的MedSAM相比有不错的性能优势。
Apr, 2023
SAM是用于图像分割的第一个通用基础模型,能以自动或手动提示的方式进行零-shot图像分割,并在不同的自然图像分割任务中取得了令人瞩目的成绩。但在医学图像分割方面仍然存在一定挑战,SAM在某些情况下表现出色,但需要结合手动标注才能取得更好的表现。
Apr, 2023
本文介绍了一种适用于医学图像分割的、从2D到3D的SAM模型的新颖改进方法,并在4个医学数据集上进行了实验,结果表明该方法可以仅通过轻量级的空间适配器有效地捕捉体积医学图像中存在的空间模式。
Jun, 2023
引入了名为 MA-SAM 的适用于各种体积和视频医学数据的模态无关 SAM 适应框架,通过在图像编码器的转换器块中注入一系列的 3D 适配器,使预训练的 2D 主干从输入数据中提取第三维信息。在四个医学图像分割任务上,使用了 CT、MRI 和外科手术视频数据的 10 个公共数据集进行全面评估,结果显示,我们的方法在不使用任何提示的情况下,始终表现优于各种最先进的三维方法,在 CT 多器官分割、MRI 前列腺分割和外科手术场景分割的 Dice 指标上分别超过 nnU-Net 0.9%、2.6% 和 9.9%。在使用提示时,我们的模型也表现出强大的泛化能力,并在具有挑战性的肿瘤分割任务中表现出色。
Sep, 2023
我们引入了一种新颖的微调框架,通过批处理基于真实掩蔽的边界框引入批量提示策略,以提高Segment Anything Model 在医学图像上的性能表现和广泛的分割任务中解决医学图像中常见的复杂性和模糊性。
Oct, 2023
通过使用Segment Anything Model(SAM)进行重新调整,我们提出了一个三阶段的框架(CFR)用于建立半监督的医学图像分割模型,并且在改善标注成本和保持性能方面取得了显著的改进。
Mar, 2024
对于自动分割医学图像的研究,本文总结了目前的微调策略,并在包括所有常见放射学模态的17个数据集上进行评估,研究发现微调 Segment Anything Model (SAM) 相较于以前的分割方法具有稍微更好的性能,使用参数效率高的学习在编码器和解码器中进行微调的策略优于其他策略,网络架构对最终性能影响不大,通过自监督学习进一步训练 SAM 可以提高最终模型性能。
Apr, 2024
我们提出了一种简单而高效的少样本微调策略,用于将Segment Anything(SAM)适应于医学图像中的解剖分割任务。我们的方法通过在SAM内对掩膜解码器进行改进,利用从有限标记图像集合(少样本收集)中导出的少样本嵌入作为查询解剖对象的提示,大大减少了需要耗时的在线用户交互。我们的方法通过只使用缓存机制训练掩膜解码器、同时保持图像编码器冻结,优先考虑了微调过程的效率。此方法不仅限于体积医学图像,而且可以普遍应用于任何2D/3D分割任务。通过对四个数据集进行全面验证,覆盖了两种模态下六个解剖分割任务。此外,我们对SAM内的不同提示选项与完全监督的nnU-Net进行了比较分析。结果表明,与仅使用点提示的SAM相比,我们的方法表现卓越(IoU提高约50%),并且与完全监督方法相媲美,同时将标记数据需求降低了至少一个数量级。
Jul, 2024
本研究解决了医学图像分割中全模型训练需要大量参数调优的问题。提出的S-SAM方法仅训练0.4%的模型参数,并利用标签名称提供精确掩膜,这使得模型更高效且减少了对专家提示的依赖。实验结果表明,S-SAM在五种不同的医学影像模态上表现优越,潜在地提高了医学图像分割的实用性。
Aug, 2024