BRONCO:使用计算机断层扫描图像自动建模支气管血管束
自动血管分割在生物医学成像中至关重要,但由于血管结构的复杂性、患者间解剖变异、公开数据集的稀缺性和图像质量等原因,精确分割仍然具有困难。本研究通过深入文献研究,探讨机器学习技术在不同器官中的应用,旨在为新型成像模态下的血管分割提供坚实的基础并确定一个稳健的基准模型。研究使用由 Hierarchical Phase Contrast Tomography (HiP CT) 在人体器官图谱项目中成像获得的三个肾脏的双注释器验证的训练数据集,并采用 nnU Net 模型进行实验评估。结果显示,尽管分割性能表现较好(clDice 值在 0.82 到 0.88 之间),但存在一些错误,如由于缺乏静水压力(HiP CT 是一种离体技术)而导致的大血管分割效果较差,以及细小血管连接性减弱和血管边界处更高的分割误差。通过本研究和输出,我们旨在为后续基于不同成像模态的模型评估建立一个基准,特别是使用 HiP CT 成像数据库。
Nov, 2023
COVID-19 大流行病反应凸显了深度学习方法在通过计算机断层扫描 (CT) 对肺部疾病的正常和异常组织进行自动分割方面的潜力,这些方法不仅有助于临床决策,还有助于理解新型疾病。为了解决手动分割大型 CT 数据库的繁重性质,我们使用多态训练优化了一个网络,以表示多个分层解剖结构,间接优化了更复杂的标签。我们结合来自不同来源的 6000 多个不同格式的手动和自动标签的 CT 扫描,使用多任务学习和多态训练开发了 MEDPSeg,一种用于单向预测肺部、气道、肺动脉和肺病变分割的端到端方法。我们在多个目标中取得了最先进的性能,特别是在地面玻璃浑浊度和病变分割方面,这是一个具有有限手动注释可用性的具有挑战性的问题。此外,我们提供了一个开源实现,具有图形用户界面的链接:https:// 此处为 URL。
Dec, 2023
利用深度学习方法实现肺叶分割,在一个手动标注的数据集上测试所提出的方法,通过设计一个混合损失函数来解决类别失衡问题,并在独立数据集上进行了测试,取得了比基线模型高达 5.87% 的表现。
Mar, 2019
通过提出基于深度学习模型的方法,可以高效且准确地分割 CTA 图像中与周围动脉疾病(PAD)手术相关的下行主动脉至髂分叉和下行主动脉至膝盖部分,为医学专业人员分析血管系统健康提供了有价值的工具。
Nov, 2023
提出了一个自动化的框架来从 CTA 图像中提取脑血管中心线,该框架包括预处理方法、基于图割和稳健核回归的管腔分割、采用拓扑感知损失和双分支设计的双分支拓扑感知 UNet (DTUNet),以及骨架化预测的管腔分割的后处理方法,实验证明该框架在平均对称中心线距离 (ASCD) 和重叠度 (OV) 方面优于现有方法,并且子组分析进一步表明该框架在中风治疗的临床应用中有潜力。
Jan, 2024
通过超分辨率模块进行空间归一化和迭代式实现分割结果,基于高水平血管分割为先验信息,在非对比度 CT 和 CTPA 上实现了精确的动脉 - 静脉分割,其量化实验证明 HiPaS 具有卓越的性能,达到 91.8% 的 DICE 分数和 98.0% 的敏感性。研究还发现,肺血管丰度与性别和年龄显著关联,女性较男性血管丰度明显更高且随年龄稍有下降,这一发现对临床诊断和了解肺生理学具有重要意义。
Apr, 2024
提出了一种用于医学图像分析中,基于深度学习的肺气道分割方法 NaviAirway,该方法采取了支气管特异性损失函数和人视感迭代训练策略,细分支气管,提升模型性能,可用于支气管镜导航、肺部疾病诊断等领域,并通过提出两个新的评价指标,更全面公正地评估基于深度学习的肺气道分割方法。
Mar, 2022
本文提出了一种仅利用支气管镜视屏数据来实现导航引导的方法,通过 CNN 对气道分割进行单帧分类并采用基于状态转移的 HMM 模型应用解剖学约束和时间上文本信息对支气管树进行定位,能够在无需电磁跟踪和 CT 扫描的情况下,实现对支气管镜操作的视觉引导。
Jul, 2023
采用两阶段的全卷积网络,在 CTA 扫描中准确自动地分割主动脉血管树,达到加速医学图像分析流程的目的,并在 2023 年 MICCAI 主动脉(SEG.A.)挑战赛中,使用公共数据集评估了该方法,取得了较高的 Dice 相似系数(0.920)、Jaccard 相似系数(0.861)、召回率(0.922)和精确度(0.926)的结果。
May, 2023