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Oct, 2023
贝叶斯多状态贝内特接受比率方法
Bayesian Multistate Bennett Acceptance Ratio Methods
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Xinqiang Ding
TL;DR
引入BayesMBAR作为MBAR方法的贝叶斯推广,在计算热力学状态的自由能值时,通过将采样自热力学状态的构型与先验分布整合,计算出自由能的后验分布,并通过后验分布得出自由能估计和估计误差。BayesMBAR能够提供比MBAR方法更准确的不确定性估计,同时也可以整合关于自由能的先验知识,提供更准确的估计结果,并有望成为自由能计算的重要工具。
Abstract
The multistate Bennett acceptance ratio (
mbar
) method is a prevalent approach for computing
free energies
of
thermodynamic states
. In this
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