论异构临床时间序列的逐步嵌入的重要性
本文提出使用语义嵌入方法,将原始、杂乱的临床数据直接与下游学习架构耦合,以实现最小化预处理。我们从捕捉和编码数据表示中的复杂数据依赖性的角度考虑这一步骤,而不是在模型中实现,该方法允许使用快速,轻量级和简单的模型进行下游处理,对于没有机器学习专业知识的研究人员非常有用。我们通过三个典型的临床预测任务证明了高度压缩的嵌入数据表示捕获了大量有用的复杂性,尽管在某些情况下,压缩并非完全无损。
Feb, 2018
通过将医学领域的知识图谱与重症监护病房的数据进行整合,结合重要体征和临床报告,提高临床决策建模的性能,特别是在数据缺失时。同时包括一个可解释性组件,以了解知识图谱节点对预测的影响。
Nov, 2023
本研究提出一种基于层次变压器架构的 ICD 编码方法,使用病人整个住院期间的所有临床笔记进行编码,并结合文本元数据嵌入,如位置,时间和笔记类型等,在使用 MIMIC-III 数据集进行测试时,模型在仅使用出院摘要作为输入时超越了以前的最佳表现,并在使用所有临床笔记作为输入时实现了进一步的表现提升。
Feb, 2023
通过自我监督训练模型来学习高质量的临床特征嵌入表示,以增强临床时间序列的表示学习能力,并通过无监督降维技术可视化学习到的嵌入表示,发现其与先前的临床知识具有高度一致性;同时在 MIMIC-III 基准数据上评估模型性能,并证明了使用临床特征嵌入的有效性。
Nov, 2023
我们提出了一个动态嵌入和分词框架,通过学习多模态临床时间序列的时间感知表示,并结合时间交叉注意力,将其整合到滑动窗口关注的多任务 Transformer 分类器中,在预测超过 120,000 例住院手术的九种术后并发症的示例任务中,使用来自美国三家医院和两个学术医疗中心的多模态数据,我们的嵌入和分词框架优于基线方法。
Mar, 2024
在重症监护室(ICU)中,多元时间序列的丰富性为机器学习提供了改进患者表型刻画的机会。与以往主要关注电子健康记录(EHR)的研究不同,本文提出了一种使用常规收集的生理时间序列数据进行表型刻画的机器学习方法。我们的新算法将长短期记忆(LSTM)网络与协同过滤的概念相结合,识别出患者之间共同的生理状态。在实际世界的 ICU 临床数据中测试,我们的方法在脑损伤患者颅内高压(IH)检测方面取得了 0.889 的曲线下面积(AUC)和 0.725 的平均精度(AP)。此外,我们的算法在学习生理信号的结构化潜在表示方面优于自编码器。这些发现突显了我们方法在利用常规多元时间序列改善临床护理实践的患者表型刻画方面的巨大潜力。
Feb, 2024
本论文通过手工建模和学习内插嵌入,采用分离机制建模不规则的时间序列;采用时间注意力机制,将临床记录的一系列表示为多元不规则时间序列,并采用交织注意机制跨时间步骤进行多模态融合,以整合多模态表示。结果表明,我们提出的方法在单一模态和多模态情景下都优于现有方法,说明了我们方法的有效性和模拟不规则性的价值。
Oct, 2022
本研究基于 Transformers 预训练的语言表示学习方法,将特定医学记录中的信息提取,映射到标准词汇中,并在医院死亡预测任务中测试不同输入格式的性能,结果表明使用提取的唯一概念和标准名称作为输入可以获得更好的性能。
Jul, 2022
提出了一个两步的框架,通过序列自动编码器无监督地学习相关病人子群并在多任务框架中对分开的病人群体进行预测,以提高住院死亡率的预测性能。需要更细粒度的绩效评估来处理异质人口。
Jun, 2018
利用长短期记忆和层次注意力机制,建立深度学习模型解决 ICU 中生理时间序列数据的不规则和缺失问题,实现对 ICU 死亡风险的预测,并在 PhysioNet 2012 数据集上取得了竞争力和可解释性的结果。
Jul, 2017