Nov, 2023
MGCT: 基于综合组织病理学 - 基因组特征的生存结局预测的互相引导的跨模态变换器
MGCT: Mutual-Guided Cross-Modality Transformer for Survival Outcome Prediction using Integrative Histopathology-Genomic Features
Mingxin Liu, Yunzan Liu, Hui Cui, Chunquan Li, Jiquan Ma
TL;DR基于深度学习的计算病理学领域的研究表明，利用全切片图像（WSIs）客观预测癌症患者预后的效果显著。然而，目前大多数预后方法局限于组织病理学或基因组学，不可避免地降低了其准确预测患者预后的潜力。为了解决这些问题，我们提出了一种弱监督、基于注意机制的多模态学习框架 —— 互相引导的跨模态转换器（MGCT），可以利用组织学特征和基因组特征来建模肿瘤微环境内的基因型 - 表型相互作用。通过使用来自癌症基因组图谱（TCGA）的五种不同癌症类型的近 3600 个 Gigapixel WSIs 进行实验，广泛的实验结果一致表明 MGCT 优于现有的最先进方法（SOTA）。