Apr, 2024

DeepLINK-T:使用 knockoffs 和 LSTM 进行时间序列数据的深度学习推理

TL;DR提出了一种新的方法 DeepLINK-T,结合深度学习和 Knockoffs 推断,在高维长时序数据中控制假发现率(FDR),实现特征选择。该方法通过使用 LSTM 自编码器生成时间序列的 Knockoff 变量,使用原始和 Knockoff 变量的 LSTM 预测网络以及应用 Knockoffs 框架进行变量选择来解决时间和特征之间的依赖关系,并通过大量模拟研究来评估其性能,表明其相对于非时序模型具有更好的特征选择能力,并应用于三个元基因组数据集来验证其实用性和有效性,展示了其在实际应用中的潜力。