Jun, 2024
基于诱导链接预测的药物-靶点相互作用图（MOTI$\mathcal{VE}$）
MOTI$\mathcal{VE}$: A Drug-Target Interaction Graph For Inductive Link
Prediction
TL;DR药物靶标相互作用的预测对于发现新的治疗方法和检测作用机制至关重要。该论文引入了MOTI$VE$数据集，该数据集包含来自七个公开数据库的细胞绘画特征、11000个基因和3600个化合物之间的关系，并提供了随机、冷源（新药物）和冷靶（新基因）数据分割，以便在实际的使用情况下进行严格评估。我们的基准结果表明使用细胞绘画特征的图神经网络一致优于仅从图结构学习、基于特征的模型和拓扑启发式方法。MOTI$VE$通过促进更可靠的药物靶标相互作用预测模型的开发，加速了图机器学习研究和药物发现。MOTI$VE$资源可在此网址获得。