Jun, 2024
QuST-LLM: 综合空间转录组学分析的大型语言模型整合
QuST-LLM: Integrating Large Language Models for Comprehensive Spatial
Transcriptomics Analysis
TL;DR本研究介绍了QuST-LLM，它是QuPath的一个创新扩展，利用大型语言模型（LLMs）来分析和解释空间转录组学（ST）数据。QuST-LLM通过提供包括数据加载、区域选择、基因表达分析和功能注释在内的全面工作流程，有效地简化了ST数据的复杂和高维属性。QuST-LLM利用LLMs将复杂的ST数据转化为基于基因本体注释的易于理解和详细的生物学叙事，从而显著提高了ST数据的可解释性。因此，用户可以用自然语言与其自己的ST数据进行交互。因此，QuST-LLM为研究人员提供了解开组织空间和功能复杂性的强大功能，促进了生物医学研究的新见解和进展。