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Sep, 2024
评估预测的蛋白质-配体构象的相互作用恢复
Assessing interaction recovery of predicted protein-ligand poses
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David Errington, Constantin Schneider, Cédric Bouysset, Frédéric A. Dreyer
TL;DR
本研究解决了当前蛋白质-配体构象预测中对相互作用评估不足的问题。论文提出了一种新方法，通过关注蛋白质-配体相互作用指纹，揭示了许多现代模型在重建关键相互作用方面的不足。其最重要的发现是，忽视这些相互作用可能会导致模型性能的过高估计，特别是在最新的蛋白质-配体协同折叠模型中。
Abstract
The field of protein-ligand
pose prediction
has seen significant advances in recent years, with
machine learning
-based methods now being commonly used in lieu of classical docking methods or even to predict all-a
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