Feb, 2025
FragmentNet:用于图到序列分子表示学习的自适应图分段
FragmentNet: Adaptive Graph Fragmentation for Graph-to-Sequence
Molecular Representation Learning
TL;DR本研究解决了现有分子属性预测方法在分子图分段时化学有效性和可扩展性不足的问题。我们提出了一种名为FragmentNet的图到序列基础模型,采用自适应学习的分词器,将分子图分解为化学有效的片段,并保持结构连通性。实验结果表明,FragmentNet在多种任务中表现优于同规模的模型,并且在资源使用上有竞争力,为分子设计和优化提供了强大的工具。