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3d molecular structures
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药物设计中的扩散模型
扩散模型在 3D 分子生成方面已经成为强大的工具,特别是在药物发现领域。这篇综述着重于定制 3D 分子生成的扩散模型的技术实现,比较了各种用于分子生成任务的扩散模型的性能、评估方法和实现细节,并探讨了扩散模型在药物设计以及与计算化学相关的领
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25 days ago
面向语言模型中的三维分子 - 文本解释
通过在语言模型中嵌入 3D 分子编码器,我们提出了 3D-MoLM:3D 分子语言建模,用于解决语言模型在理解三维分子结构方面的限制,在生物分子领域具有潜力。
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5 months ago
基于自回归片段的扩散策略在口袋感知的配体设计中的应用
该论文介绍了 AutoFragDiff,一种基于片段的自回归扩散模型,用于生成以目标蛋白质结构为条件的 3D 分子结构。我们使用几何矢量感知器预测新的分子片段的原子类型和空间坐标,以分子支架和蛋白质口袋为条件。我们的方法改善了生成的 3D
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7 months ago
条件生成神经网络逆向设计三维分子结构
本篇论文提出了一种基于条件生成神经网络的三维分子结构的设计方法,该方法不依赖于化学键,并能针对特定分布生成新颖分子,同时能够逆向设计并发现稳定的分子,在多种电子性质方面提高了生成效能。
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3 years ago
使用深度生成模型基于受体结合位点生成三维分子结构
本研究实现了基于深度生成模型、卷积神经网络和可变潜空间的三维分子结构生成,在此基础上,也为优化生成的分子性质提供了初始方法。
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4 years ago
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