biomedical text mining | BriefGPT

关键词biomedical text mining

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ClinLinker：西班牙语临床概念提及的医学实体链接
这项研究通过使用一种新颖的双阶段流程来实现医学实体链接，该流程利用领域内适应的语言模型进行生物医学文本挖掘，从而显著提升了临床文本分析的性能。该方法在西班牙语内容的初期侧重下，在涉及异构医学术语并在原始数据子集上进行训练的复杂场景中，显著优
PDF3 months ago
推进生物医学文本挖掘的社区挑战
对中文生物医学文本挖掘的社区挑战进行了综述和比较分析，总结了其在生物医学研究中的潜在临床应用以及在大语言模型时代的贡献、局限和未来发展方向。
PDF4 months ago
跨语料库评估中的 HunFlair2 命名实体识别和规范化工具
通过对 28 种已发布系统的调查，我们在三个公开可用的语料库上深入分析了五种不同实体类型的性能比较，发现 BTM 工具在异构数据集上的性能明显低于同质数据集中的结果，表明在野外应用中 BTM 工具的性能会下降，需要进一步的研究以增强其稳定性
PDF4 months ago
医疗领域大型语言模型的分析：以 BioBERT 为案例研究
本研究全面调查了大型语言模型（尤其是 BioBERT）在医疗保健领域的应用。它从彻底检查先前的自然语言处理（NLP）方法在医疗保健领域的应用开始，揭示了这些方法面临的限制和挑战。随后，研究探索了将 BioBERT 应用于医疗保健应用的路径，
PDF9 months ago
基于文献的发现（LBD）：面向生物医学文本挖掘的假设生成和知识发现
生物医学文本挖掘中，基于文献的发现是自动发现医学术语之间新的关联的过程，该过程依靠创建医学术语的概念配置文件并根据共享配置文件的统计显著性将其与药物和治疗联系起来。该文回顾了基于文献的发现的各种方法和应用，并探讨了深度学习在该领域的应用及其
PDF9 months ago
Bioformer：面向生物医学文本挖掘的高效 Transformer 语言模型
本研究提出了 Bioformer，一种用于生物医学文本挖掘的紧凑型 BERT 模型，它在 PubMed 文摘和 PubMed Central 全文文章上进行了预训练，使用生物医学词汇表。Bioformer 相对于 BERTBase 减小了
PDFa year ago
基于联合学习的生物医学文献因果关系抽取
本文提出了一种基于联合学习模型的生物医学因果关系提取方法，将实体关系提取和实体功能检测结合起来，以提高因果关系提取的性能，并且在模型训练阶段，为不同的功能类型分配不同的权重，实验结果表明，与其他系统相比，我们的联合学习系统在 BEL 语句提
PDF2 years ago
生物医学文献的多标签分类: BioCreative VII LitCovid 赛道 COVID-19 文献主题注释概述
该研究报告主要讨论了如何利用生物医学文本挖掘方法自动分配主题标签以便更好地理解和利用 LitCovid 数据库中的 COVID-19 相关文章，以促进疫苗和药物的研发。
PDF2 years ago
RuBioRoBERTa：用于俄语生物医学文本挖掘的预训练生物医学语言模型
本文介绍了基于 BERT 模型的俄语生物医学文本挖掘模型（RuBioBERT，RuBioRoBERTa）。这些模型在俄语医学领域的文本语料库上进行预训练，并在俄罗斯医学语言理解基准（RuMedBench）上展现了最新的成果，包括文本分类、问
PDF2 years ago
医学摘要的分类分节：一系列序列分类任务
本研究基于最先进的深度学习模型（SSN-4 模型），探讨了不同的模型组件对表现和复杂性之间的平衡，同时调整单词嵌入来提高性能，并提出了一个解决第一个模型中混淆的对的第二个模型。结果表明，SSN-4 模型似乎不适用于 RCT 数据集之外。
PDF2 years ago
WSDM面向中文生物医药文本挖掘的概念化表征学习
本文研究如何将预训练语言模型 BERT 改进适用于中文生物医学文本，并提出了一种新的概念化表示学习方法。我们还发布了一个新的中文生物医学语言理解评估基准（ extbf {ChineseBLUE}），实验结果表明我们的方法可以获得显著的收益。
PDF4 years ago
EMNLP实时回答 COVID-19 问题
本论文介绍了 covidAsk，一个基于生物医学文本挖掘和问答技术结合起来的用于实时回答问题的问答系统，并使用 COVID-19 Questions 数据集对其进行了评估。该系统被设计来帮助研究人员寻找关于新冠病毒和未来疫情的知识和信息。
PDF4 years ago
BioBERT：用于生物医学文本挖掘的预训练生物医学语言表示模型
本文介绍了如何将自然语言处理 (NLP) 中最新的预训练语言模型 BERT 应用于生物医学文献的文本挖掘，并提出了一种自然语言处理 (BioBERT) 模型用于生物医学文本挖掘，该模型在以前的生物医学文本挖掘任务中表现得比 BERT 好并且
PDF5 years ago