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基于字典为基础的同义词概括的生物医学命名实体识别
本研究提出了一种新的同义词泛化（SynGen）框架，使用基于跨度的预测识别输入文本中包含的生物医学概念。通过引入同义词距离正则化器和噪声扰动正则化器，该框架能够降低同义词泛化误差。本研究在多个基准测试中广泛评估了我们的方法，结果表明，Sy
PDFa year ago
生物医学自然语言处理中的大型语言模型：基准、基线和建议
本研究通过实验验证了 GPT-3 和 GPT-4 在 8 个 BioNLP 应用中的性能表现，并对其识别错误进行了分析，提出了在 BioNLP 应用中使用 LLMs 的建议。
PDFa year ago
EMNLP使用蒸馏的 BERN2 和 Kazu 框架进行企业级生物医学命名实体识别
本文介绍了 KAZU 框架，它是一个高度可扩展、可伸缩性的开源框架，旨在支持制药业的生物医学命名实体识别和链接，并包装了几种其他的 BioNLP 技术成为一个连贯的系统，可满足现代制药公司的所有需求。
PDF2 years ago
深度双向语言 - 知识图谱预训练
用自我监督的方法，从文本和知识图谱中预先训练出深度语言 - 知识图谱联合模型 DRAGON，而 DRAGON 在一系列下游任务中实现了良好性能，尤其是在语言和知识复杂推理方面的优异表现，以及在各种 BioNLP 任务中的最新成果。
PDF2 years ago
EMNLP利用预训练语言表示和最少任务特定架构的生物医学关系提取
本文介绍了我们参与 2019 年 BioNLP 开放共享任务的 AGAC Track，我们提供了 Task 3 的解决方案，该方案旨在提取 “基因 - 功能变化 - 疾病” 三元组，其中 “基因” 和 “疾病” 分别是特定基因和疾病的提及，
PDF5 years ago
ACL减少 BioNLP 注释成本的方法
开发了一种名为 ClosestInitPA 的主动学习算法，特别适用于在训练数据冗余、注释成本高、支持向量机适用的任务和不平衡的数据集（即在构建二元分类问题时，其中一个类别比另一个类别稀少得多）中显著降低 BioNLP 任务的注释成本。
PDF10 years ago
PubMed 概要中疾病提及标注的微任务众包
通过研究发现，微任务众包平台能够有效地捕捉 PubMed 文摘中的疾病提及，并通过专家投票方法将多个工作者的注释合并，生成 BioNLP 领域中完全标注的语料库。
PDF10 years ago