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基于变分自编码器的前体微小 RNA 的描述生成
基于变分自动编码器的生成建模方法应用于微小 RNA 的分类，取得了较高的重建和分类效果，并生成了准确的微小 RNA 描述。
PDF7 months ago
基因组解释器：一种具有 1D 平移窗口变换器的层次基因组深度神经网络
本研究利用建立新的架构模型 Genomic Interpreter 对基因组测序数据进行预测，通过整合 1D-Swin 对数据的层级依赖性进行建模，成功识别染色质可及性和基因表达的预测，揭示了基因调控的潜在语法。
PDFa year ago
一个单细胞基因表达语言模型
提出了 Exceiver 模型，使用同一自我监督任务来处理单细胞 RNA 表达数据，学习基因之间的上下文依赖关系，并证明该模型具有迁移学习能力。
PDF2 years ago
NIPS出席并预测：关于染色质上选择性注意力的基因调控理解
本文介绍了一种基于深度学习的 AttentiveChrome 方法，用于对基因调控中的染色质因子进行依赖建模和预测，同时对 56 个不同的人类细胞类型进行评估，并提供更好的解释性能力。
PDF7 years ago
DeepChrome：基于深度学习的组蛋白修饰预测基因表达
该研究开发了一种名为 DeepChrome 的深度卷积神经网络的系统，该系统可以将组蛋白修饰数据作为输入，从而自动提取重要功能之间的复杂相互作用，以实现基因表达的分类。这一系统不仅超越了现有技术，还发展了一种基于优化的新颖技术以从深度模型中
PDF8 years ago
deepTarget: 一种基于深度循环神经网络的 microRNA 靶点预测端到端学习框架
本文提出一种基于深度递归神经网络的自编码及序列交互学习，利用端到端的机器学习框架进行 miRNA 靶向预测，不仅准确性高，而且消除了手动特征提取的需求，该方法相比于现有的替代方案更为优秀，并取得了 miRNA 靶向预测领域巨大的进步。
PDF8 years ago