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molecular dynamics
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利用机器学习力场实现精确分子动力学模拟
通过将时空物理对称性结合到梯度域机器学习(sGDML)模型中,从高级初步计算中直接构建灵活的分子力场,为实现分子模拟中的光谱精度提供关键缺失成分。
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6 years ago
SchNet - 分子和材料的深度学习架构
使用 SchNet 这种特定深度学习架构模拟原子系统,预测化学空间中分子和材料的一些性质,以及分子动力学模拟中的势能面和保能力场,实现了 C20-fullerene 的量子力学性质的研究。
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7 years ago
SchNet: 用于建模量子相互作用的连续滤波卷积神经网络
应用连续卷积层的 SchNet 深度学习架构能够建模分子中的量子相互作用,从而实现总能量和原子间力的预测,并在平衡分子和分子动力学轨迹的基准测试中取得了最先进的性能。同时,该架构引入了更具有挑战性的基准测试,为进一步研究提供了有价值的方向。
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7 years ago
从分子动力学到布朗动力学
本文研究三种粗粒化分子动力学模型,利用分子动力学模拟在计算域中的部分和(不太详细的)布朗动力学模拟在剩余的域中来开发和分析多尺度方法。结果应用于细胞膜上的受体蛋白结合的简化模型,证明现代胞内过程的 BD 模拟器可以在大块材料中精确耦合,也可
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10 years ago
速度重调整规范取样
我们提出了一种新的分子动力学算法,用于对正则分布进行抽样,该算法在 Lennard-Jones 和 TIP4P 水模型中表现出良好的性能。
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16 years ago
自适应分辨率模拟液态水的扩散动力学建模
本文提出了一种双分辨率分子动力学模拟方法,并采用自适应分辨率方案 (AdResS) 对液态水进行了模拟研究,证明了该方法可以在不同分辨率下精确地描述水的动力学、结构和热力学性质。
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17 years ago
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