molecular simulation | BriefGPT

关键词molecular simulation

搜索结果 - 7

玉米导航：用于分子模拟的循环和条件计算图
Maize 是一个基于流程编程原理的工作流管理器，可以执行任意图结构，并在计算化学、分子模拟和计算药物设计等领域展现出良好的效果。
PDF6 months ago
从初始到最终状态的反应路径构建的生成模型
基于神经网络的方法通过迭代过程，根据初始状态的坐标生成了反应路径的近似表示和最终状态的坐标，适用于复杂的有机反应路径并能根据预设条件或随机方式生成反应。
PDF6 months ago
OpenMM 8：使用机器学习势的分子动力学模拟
机器学习在分子模拟中扮演重要且日益增长的角色，OpenMM 分子动力学工具包的最新版本引入了新特性，支持使用机器学习模型进行模拟优化。
PDF9 months ago
粗粒度力场的对比学习
本文介绍了一种被称为 “potential contrasting” 的新方法，可以更好地学习分子系统的复杂能量地形，生成准确的力场来再现精细分辨率分子模拟的构象分布。这种方法在仅使用 α- 碳的粗粒度模型时，已经成功地应用于 Trp-ca
PDF2 years ago
分子模拟的机器学习
介绍了机器学习在分子模拟及预测量子力学能量与力学、粗粒化分子动力学、提取自由能面和生成网络方法等应用方面的研究进展，同时探讨了在此领域中的一些挑战。
PDF5 years ago
利用卷积和潜在插值强制执行物理规则学习蛋白质构象空间
利用卷积神经网络从蛋白结构中学习连续的构象空间表示，实现预测连接蛋白的不同构象状态的生物相互作用，并利用转移学习从一个蛋白结构中迁移特征以提高性能。
PDF5 years ago
使用幺正耦合簇 ansatz 的量子计算分子能量的策略
本研究研究了 VQE 算法在使用 UCCansatz 模拟分子能量上的应用，引入了新策略来减少 UCC 的电路深度和改善波函数的优化，同时还提出了一种分析方法来计算能量梯度，从而减少了梯度估计的采样成本，并在数字模拟中展示了我们的方法。
PDF8 years ago