protein pockets | BriefGPT - AI 论文速递

关键词protein pockets

搜索结果 - 5

FragXsiteDTI：用 Transformer 驱动的解读方法揭示药物靶向相互作用中的关键部分
利用 FragXsiteDTI 模型，同时运用药物分子碎片和蛋白质口袋，优化了药物靶标相互作用预测的模型解释性和性能，其详细的蛋白质和药物的信息表征提供了药物靶标相互作用的详细视角。通过 Perceiver IO 框架，模型的可学习潜在数组
PDF8 months ago
ICML学习亚口袋原型以实现可推广的基于结构的药物设计
本文提出了 DrugGPS 方法用于结构为基础的药物设计，通过学习亚口袋原型并构建全局交互图，模拟亚口袋原型与分子模体之间的相互作用，同时使用层次图转换编码器和基于模体的 3D 分子生成方案来提高模型性能，实验结果表明该方法的实用性在现实应
PDFa year ago
基于结构和等变扩散模型的药物设计
使用机器学习方法建立了一个新颖的三维生成模型 DiffSBDD，用于设计小分子配体与指定蛋白质靶点高度亲和并具有特异性。 DiffSBDD 通过生成出新型具有高结合能量的药物配体，展现了显著的效率和多样性。
PDF2 years ago
ICMLPocket2Mol: 基于蛋白质 3D 结构口袋的高效分子采样
Pocket2Mol 是一个用于 in silico 药物设计的 E (3)- 等变生成网络，它能采样新的受约束化合物，考虑了蛋白质袋的结构。从 Pocket2Mol 中采样的分子具有显著更好的结合亲和力和其他药物性质。
PDF2 years ago
GENEOnet: 基于群等变非扩张算子的新型机器学习范例。应用于蛋白质口袋检测
该研究介绍了一种基于等变群的非扩张算子的计算新范式，称为 GENEOnet，可以用于解释机器学习和药物设计中的问题，其结果表明 GENEOnet 在准确性方面具有优异性能。
PDF2 years ago