protein-ligand interactions | BriefGPT

关键词protein-ligand interactions

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基于几何信息的 GFlowNets 用于结构化药物设计
利用生成流网络（GFlowNets）有效地探索药物样分子的组合空间，改进了 GFlowNet 框架，以增强生成特定蛋白质口袋的分子的能力，并通过使用 CrossDocked2020 数据集的实验证明了生成分子与蛋白质口袋之间的结合亲和力的提
PDF18 days ago
AAAI基于结构的药物设计的绑定自适应扩散模型
基于结构的药物设计旨在生成与特定蛋白质靶点结合的三维配体分子。本研究提出了一种名为 Binding-Adaptive Diffusion Models (BindDM) 的新框架，通过自适应地提取负责蛋白质 - 配体相互作用的结合位点的关键
PDF6 months ago
学习物理学为基于结构的虚拟筛选提供姿态敏感性
该研究针对药物发现中存在的问题，通过新的模型和基准测试，实现了在结构虚拟筛选中成功识别生物活性配体的目标，并克服了深度学习方法不敏感于蛋白质 - 配体相互作用的限制。
PDF3 years ago
蛋白质配体结合基团的综合结构分类
通过数据库搜索和匹配算法，对蛋白数据银行中超过 18 万个配体结合位点进行了全对比，共确定了约 3000 个明确定义的配体结合位点的结构模式，并发现这些结构通常局限于单个家族或超家族，并与特定的配体相关联。同时，分析了相似性网络的组成，并列
PDF16 years ago