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protein-protein interactions
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使用 PubMed 摘要的基于 BioBERT 的弱监督方法将功能分配给蛋白质相互作用
使用基于 BioBERT 的深度学习技术从 PubMed 文摘中提取蛋白质相互作用 (PPI) 的功能类型,对这些信息进行标注。这项工作证明了通过对生物医学文摘的分析,可以大规模提高在线数据库中带有功能注释的蛋白质相互作用的数量。
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4 years ago
基于能量的图卷积网络在蛋白质对接模型评分中的应用
本篇研究使用基于图卷积网络的深度学习模型,将蛋白质的三维结构表示为节点和边特征的联系图,并成功地将其应用于蛋白质对接领域中的评分和质量评估问题,与现有方法相比,获得了显著的改进。
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5 years ago
EL Embeddings: 用于描述逻辑 EL++ 的模型的几何构建
本研究在解决如何为复杂的信息或知识库创建向量空间嵌入,以便于机器学习、相似性搜索或类似任务时能更有效地用于预测蛋白质相互作用。
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5 years ago
序列协同演化揭示蛋白质复合物的 3D 接触和结构
该研究表明,通过分析蛋白质序列之间的相关进化序列变化,可以准确识别与蛋白质配对的残基,从而确定蛋白质复合物的三维结构,可用于残基分辨率下的互作预测,并且随着序列数据库的增长,这种方法可以扩展到基因组范围内蛋白质相互作用网络的阐明和互作预测。
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10 years ago
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