rna | BriefGPT - AI 论文速递

关键词rna

搜索结果 - 6

BEACON：全面 RNA 任务与语言模型的基准
介绍了首个全面的 RNA 基准测试 BEACON，包括 13 个任务，涵盖了结构分析、功能研究和工程应用，通过评估不同 RNA 理解任务的方法性能，研究了传统方法和基于语言模型的先进 RNA 基础模型，以及关键的 RNA 语言模型组件。基于
PDF20 days ago
使用基于 Transformer 的深度学习模型来进行 RNA 二级结构预测
讨论了 RNA 和 RNA 的二级结构及其预测的基本概念，以及机器学习技术在预测生物大分子结构中的应用，并提出了基于 ResNet 的 RNA 三级结构预测算法和打分模型。
PDF3 months ago
RiNALMo：通用目的的 RNA 语言模型在结构预测任务上具有良好的泛化能力
RiNALMo 是最大的 RNA 语言模型，能够从 RNA 序列中提取隐藏的知识并捕捉内在的结构信息，在多个下游任务中取得了 state-of-the-art 的结果，并且具有通用能力能够克服其他深度学习方法在未见过的 RNA 家族上泛化的
PDF4 months ago
rnaglib 中基于 3D 的 RNA 功能预测工具
通过 rnaglib，我们使用 RNA 3D 结构数据集训练监督和无监督的机器学习模型来预测功能。
PDF5 months ago
MM利用二次二进制优化预测 3D RNA 折叠模式
本文基于 QUBO 模型，通过添加不同的惩罚和奖励来提高 RNA 三维结构预测的准确性，并使用新的加权相似性结构度量来处理多个近似最优解的问题，同时使用 AlphaQUBO 解算器求解数以千计的二进制变量问题。
PDF3 years ago
罗塞塔无法解决的四个小谜题
通过测试 20 个氨基酸小蛋白的三维结构、小型缩二巯基 - 稳定的海螺毒素、丝氨酸蛋白酶抑制剂的反应环以及 UUCG RNA 四元环等四个建模案例，本文表明 Rosetta 分子建模套件在预测这类小分子方面表现不佳，结论是 Rosetta
PDF13 years ago