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scRDiT: 扩散变压器生成单细胞 RNA 测序数据并加速采样
利用单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 技术，该研究介绍了一种基于生成式方法 (scRDiT) 的神经网络模型，能够重现具有相似统计特性的虚拟 scRNA-seq 数据集，实验证明其优越性能。
PDF3 months ago
scCDCG: 基于深度剪切信息图嵌入的单细胞 RNA 序列的高效深度结构聚类
通过引入 scCDCG（基于深度剪切信息图的单细胞 RNA 测序聚类）框架，我们解决了传统聚类方法在 scRNA-seq 数据分析中忽略基因表达特征中嵌入的结构信息所带来的问题，提出了一种有效且准确的聚类方法，能够同时利用细胞间的高阶结构信
PDF3 months ago
单细胞 RNA-seq 合成与潜在扩散模型
提出了一种基于扩散模型的全新方法 Single-Cell Latent Diffusion (SCLD)，可以在一个统一的框架内合成大规模、高质量的单细胞 RNA 测序样本，包括整体和特定的细胞亚群，实验结果显示了其在细胞分类和数据分布距离
PDF7 months ago
scHyena: 全长单细胞 RNA 测序大脑分析的基础模型
通过介绍 scHyena 模型，本研究提出了一种解决脱落事件和基因表达信息利用有限的测量噪声带来的挑战，以提高脑部 scRNA-seq 分析准确性的新方法，展示了该模型在细胞类型分类和 scRNA-seq 填补方面相比其他基准方法的卓越性能
PDF9 months ago
ICML基于 scRNA-seq 和空间转录组学的非配对数据联合模型，用于填充丢失的基因表达测量值
本文提出了一种基于深度生成模型 gimVI 的方法，用于整合空间转录组学和单细胞 RNA 测序数据以推断空间转录组学数据中缺失的基因表达信息并比较了其与其他方法的性能。
PDF5 years ago