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single-cell biology
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ChatCell:以自然语言促进单细胞分析
通过 ChatCell,我们实现了单细胞分析的自然语言化,为解决单细胞数据的知识壁垒和可扩展性的挑战提供了新的范式,进一步深化了单细胞领域的洞察力,为更加易于访问和直观的探索铺平了道路。
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5 months ago
生成熵神经最优传输在空间内和空间间的映射
学习度量到度量映射是机器学习中的一项关键任务,而神经最优输运方法(Neural OT)结合了神经网络模型和最优输运理论,将最优输运作为归纳偏置,并通过实验表明其在单细胞生物学中具有实用性。
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9 months ago
循环一致的半耦合神经非平衡最优输运
本文提出了一种名为 NubOT 的神经非平衡最优输运 (OT) 方案,针对单细胞生物学领域中在不同时间点上获取的未配对分布或人群的比较问题,通过半耦合形式学习数据分布之间的最优耦合,解决了传统 OT 中质量守恒假设在人群大小变化时的不平衡场
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2 years ago
MAGAN: 对齐生物多样性
本文介绍了一种新的基于生成式对抗网络模型的数据集成方法:Manifold-Aligning GAN (MAGAN),并通过单细胞生物学实例表明其可行性,该方法能够成功的将两种不同的测量类型(基因组学和蛋白组学)进行对齐,从而加强其对生物信息
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6 years ago
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