structure-based drug design | BriefGPT

关键词structure-based drug design

搜索结果 - 26

基于几何深度学习的结构药物设计系统性调查
本文系统地回顾了几何深度学习在基于结构的药物设计中的最近进展，并包括了结合位点预测、结合姿势生成、分子生成、连接器设计和结合亲和力预测等任务的详细综述和相关进展的挑战以及潜在机会。
PDFa year ago
ICML学习亚口袋原型以实现可推广的基于结构的药物设计
本文提出了 DrugGPS 方法用于结构为基础的药物设计，通过学习亚口袋原型并构建全局交互图，模拟亚口袋原型与分子模体之间的相互作用，同时使用层次图转换编码器和基于模体的 3D 分子生成方案来提高模型性能，实验结果表明该方法的实用性在现实应
PDFa year ago
Lingo3DMol: 基于口袋的三维分子生成语言模型
本文提出了一种基于口袋的三维分子生成方法，利用具有生成 3D 坐标能力的语言模型，并设计了扰动复原预训练任务，介绍了一种新的分子表示方法，并利用 CrossDocked 和 DUD-E 数据集对其进行了评估。该方法在几乎所有指标上实现了最优
PDFa year ago
基于结构和等变扩散模型的药物设计
使用机器学习方法建立了一个新颖的三维生成模型 DiffSBDD，用于设计小分子配体与指定蛋白质靶点高度亲和并具有特异性。 DiffSBDD 通过生成出新型具有高结合能量的药物配体，展现了显著的效率和多样性。
PDF2 years ago
用于基于结构药物设计的三维生成模型
本文提出了一种生成指定蛋白质结合位点分子的 3D 生成模型，可应用于结构基因设计任务，通过学习原子的概率密度分布并提出自回归采样策略，实现了生成有效和多样性分子的能力，在实验结果中表现出较高的亲和力和良好的药物特性。
PDF2 years ago
卷积神经网络在蛋白质 - 配体评分中的应用
本研究利用深度卷积神经网络结合大量蛋白质配体结合和结构数据，开发了一种新的评价蛋白质配体相互作用的计算方法，可以用于计算机辅助新药研发并取得了比传统方法更好的效果。
PDF8 years ago