系统进化卷积神经网络在宏基因组学中的应用
本文介绍了一种使用卷积神经网络（CNN）进行生物信息学任务的方法，包括将甲基基因组数据映射为有意义的 1D 或 2D 图像，用于预测各种疾病。该方法在六个不同的数据集上应用，包括总共 1000 多个来自多种疾病的样本。
Dec, 2017
本文介绍了一种使用 Cartesian 遗传编程自动构建卷积神经网络结构的方法，并通过将其应用于 CIFAR-10 数据集的图像分类任务验证了该方法的有效性。
Apr, 2017
我们提出了一种名为 PHG-Net 的方法，利用持久同调技术来探索医学图像分类中的拓扑特征，通过轻量级的 PH 模块将拓扑特征与卷积神经网络或 Transformer 结合，实现综合特征提取和融合，从而在目标分类任务中显著改善了现有方法。
Nov, 2023
自动疾病分类、杂草分类和作物分类是农业未来中非常重要的一部分，通过计算机视觉进行自动化，然而现有的模型架构如 ResNet、EfficientNet 和 ConvNeXt 在类似项目的小规模专门数据集上常常表现不佳，我们通过数据采集和开发新的 CNN 架构 PhytNet 来填补这一空白，利用红外可可树图像的新数据集，展示 PhytNet 的发展并将其性能与现有架构进行比较，数据采集受到光谱分析数据的启发，该数据提供了有关可可树的光谱特性的有用见解，这些信息可以指导未来的数据采集和模型发展，鉴于可可树病害的多样性，因此选择可可树作为焦点物种是因为其病害存在较大的挑战，ResNet18 显示出一些过拟合迹象，而 EfficientNet 变体则显示出明显的过拟合迹象，相比之下，PhytNet 对相关特征具有良好的关注度，没有过拟合，而且计算成本异常低（1.19 GFLOPS），因此 PhytNet 是快速疾病或植物分类，或疾病症状的精确定位自主系统的有希望的候选方案。
Nov, 2023
本研究主要使用 BCNN 方法对星系进行形态分类，通过卷积神经网络（CNN）训练不同类别的星系图像，并结合贝叶斯网络进行预测，结果显示 BCNN 在多个评估指标上表现优于其他 CNN 模型。
May, 2024
Phylo-NN 是一种无需标签，直接从昆虫图片中提取进化特征序列的方法，对鱼类进行了演示，证明了其用于物种图像生成和物种 - 物种图像转换的有效性。
Jun, 2023
研究了利用多尺度分解通过层次拓扑信息的新型体系结构，并通过 Girvan-Newman 层次聚类算法生成了一棵树，使得架构可以学习从粗到细的多尺度潜在空间表示，并在基准引文网络上表现出竞争力。
Jun, 2020
本文提出了一种利用遗传算法优化深度卷积神经网络结构和连接权重初始化的图像分类算法，该算法利用一个高效的可变长度基因编码策略和新的表示方案初始化深度卷积神经网络的连接权重，并提出了一种新的适应度评估方法，实现了在少量计算资源下的快速启发式搜索，与其他 22 个现有算法相比在九个广泛应用于图像分类的任务中表现明显优越。
Oct, 2017