基于GAN的虚拟染色:全切片图像分析的有希望解决方案
利用深度学习方法的CycleGANs,不需要专家选择代表性的参考标本,解决了数字化组织学诊断中由于多种因素引起的染色剂颜色变化引起的难题,并在乳腺癌肿瘤分类等临床应用中得到了验证。
Apr, 2018
提出使用生成对抗网络(GAN)的Generative Stain Augmentation Network(G-SAN)来消除组织切片染色不同的变异性对机器学习诊断工具的影响,并通过补充染色变异性数据,使得机器学习模型更加健壮。通过组织学图像的核分类和分割任务的结果,证明使用G-SAN的增强数据平均提高了F1得分15.7%和齐柏林物质的质量7.3%。
May, 2023
提出了一种将组织标本的染色信息进行生成的新型生成模型,该模型包含结构信息和注意力模块,且引入了两个与虚拟染色特异性相关的新定量度量指标。
Aug, 2023
引入了结合可解释性特征和保存结构能力的xAI-CycleGAN先进架构,用于将H&E染色的乳腺组织图像转换成类似P63染色的图像,并展示了其在保持结构完整性和生成高质量图像方面的有效性,验证了该模型的高质量输出。
Dec, 2023
StainDiffuser是一种新颖的多任务双扩散架构,用于通过有限的训练预算实现虚拟染色,能同时训练细胞特异性的免疫组织化学染色和基于HE的细胞分割。
Mar, 2024
介绍了一种用于虚拟染色任务的新型网络 In-and-Out Net,基于生成对抗网络(GAN),能够将表皮镜下反射共聚焦显微镜(RCM)图像高效地转化为血红素和噻唑蓝(H&E)染色图像,提供了用于虚拟染色任务的有价值的工具,推动了组织学图像分析领域的发展。
May, 2024
路径学语义保持学习方法 (PSPStain) 提出了两种新颖的学习策略:1) 以蛋白质感知为中心学习的策略(PALS),通过焦点光密度(FOD)图维持蛋白质表达水平的一致性,即代表分子级语义信息;2) 原型一致学习策略(PCLS),通过原型一致性学习增强图像间的语义互动。PSPStain 在两个公共数据集上评估了其性能,使用了五个指标:三个与临床相关的指标和两个与图像质量相关的指标。大量实验证明,PSPStain 胜过当前最先进的 H&E-to-IHC 虚拟染色方法,并展示了真实和虚拟染色分期之间的高度病理学相关性。
Jul, 2024
本研究解决了传统免疫组织化学染色方法在检测三级淋巴结构(TLSs)中的局限,提出了一种新颖的掩膜引导对抗转移学习方法,用于虚拟病理染色。研究表明,VIPA-Net显著提高了在H
Aug, 2024
本研究解决了现有虚拟全幻灯片图像生成方法在瓦片边界存在内容、纹理和颜色不一致的问题,这可能影响临床评估的准确性。提出的CC-WSI-Net网络利用GAN模型,集成一致性监督机制,确保生成的合成全幻灯片图像在各个瓦片之间无缝且一致。研究结果显示,该方法提升了图像质量,并为今后虚拟染色技术在研究和临床护理中的广泛应用铺平了道路。
Oct, 2024