Jan, 2022
AntBO:基于组合贝叶斯优化的实时自动抗体设计
AntBO: Towards Real-World Automated Antibody Design with Combinatorial Bayesian Optimisation
Asif Khan, Alexander I. Cowen-Rivers, Antoine Grosnit, Derrick-Goh-Xin Deik, Philippe A. Robert...
TL;DR提出了用于优化抗体 CDRH3 区域的贝叶斯优化框架 AntBO,该框架使用 Absolut!软件来评估抗体对特定抗原的特异性和亲和力,并通过引入 CDRH3 信任区域来限制具有有利发展性得分的序列搜索,最终在仅使用少量黑盒函数调用的情况下,在 159 个抗原和 38 个蛋白质设计中发现了高达 69 万个实验得到的序列和常用遗传算法基线的最佳结合序列。