ICLRAug, 2022
基于条件的抗体设计作为三维等变图形翻译
Conditional Antibody Design as 3D Equivariant Graph Translation
Xiangzhe Kong, Wenbing Huang, Yang Liu
TL;DR本文提出了多通道等变注意力网络（MEAN）用于抗体设计，通过导入目标抗原和抗体的轻链等组件，将抗体设计公式化为条件图转换问题，并采用 E (3)- 等变信息传递和建议的注意力机制来更好地捕捉不同组件之间的几何关系，最终通过多轮渐进式全射法输出了 1D 序列和 3D 结构，相对于先前的自回归方法，我们的方法在序列和结构建模、抗原结合 CDR ，结合亲和力优化等方面的表现显著优于现有的最先进模型，特别是在抗原结合 CDR 设计和亲和力优化方面表现出了约 23% 和 34% 的相对改进。