Jun, 2023
蛋白质 - 配体结合亲和力预测的多任务生物测定预训练
Multi-task Bioassay Pre-training for Protein-ligand Binding Affinity Prediction
Jiaxian Yan, Zhaofeng Ye, Ziyi Yang, Chengqiang Lu, Shengyu Zhang...
TL;DR本文提出了多任务生物测定预训练框架 (MBP)，该模型结合蛋白质 - 配体复合物的三维结构作为输入来预测蛋白质 - 配体结合亲和力，利用 ChEMBL-Dock 数据集对不同亲和力标签的预测进行多任务预训练，并且分类了相对排名是否来自同一生物测定，通过实验证明 MBP 作为通用框架能够改进并针对主流结构基预测任务。