Jul, 2023

可解释的用于分析流式细胞仪细胞转化器的技术

TL;DR对于临床应用而言,深度学习模型的解释性尤为重要,尤其是在自动化系统的决策具有深远影响的情况下。本文评估了一种名为 ReluFormer 的 Transformer 模型在 Flow CytoMetry(FCM)数据上的应用,提出了一种针对 FCM 的基于梯度和注意力的可视化技术,并通过儿科急性淋巴细胞白血病(ALL)FCM 样本的细胞分类和多边形回归进行了定性评估,结果展示了模型的决策过程以及如何利用所提出的技术来检查已训练模型的情况。梯度可视化不仅能够识别对特定预测最重要的细胞,还能指示在 FCM 特征空间中,哪些变化对预测影响最大。而注意力可视化则提供了有关 Transformer 在处理 FCM 数据时的决策过程的洞察,我们展示了不同的注意力头在关注不同的生物学意义的子种群上具有专门化的能力,尽管在训练过程中该模型仅利用了监督二元分类信号。