Sep, 2023

基于标签高效的对比学习模型的三维心血管免疫荧光图像核的检测与分类

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TL;DR我们提出了一种基于可标注效率的对比学习模型（LECL），用于在 3D 免疫荧光图像中检测和分类各种类型的细胞核，该方法克服了使用点注释进行训练时的困境，并采用扩展的最大强度投影方法解决了多个 z 堆叠帧引起的问题。我们在心血管数据集上进行了实验，并发现我们的框架在检测和分类 3D 免疫荧光图像中的各种细胞核方面是有效且高效的。
deep learning-based methodsnuclei detectionweak-annotation methods3d immunofluorescent imageslabel-efficient contrastive learning-based (lecl) model
发现论文，激发创造
  • 使用三维心血管免疫荧光图像中的点注释进行弱监督的深度个体细胞核检测

    本研究旨在开发一种自动计数血管壁动脉粥样硬化斑块细胞的方法，并使用弱监督学习方法训练 HoVer-Net 模型来检测荧光图像中的细胞核，并使用熵最小化损失函数来提高该模型在周围未标记区域的预测置信度。

    Jul, 2022

  • NuCLS: 一种可扩展的众包深度学习方法与数据集，用于细胞核分类、定位和分割

    本文中，我们介绍了一种吸引医学生和病理学家参与的方法，用于在乳腺癌中标注细胞核的数据集，其中建议的注释可以通过弱算法来改善，该算法可用于训练分割算法，这种方法被称为 DTALE，旨在通过核分割和形态学特征来提高核分类模型的透明度。

    Feb, 2021

  • 循环学习：连接图像级标签和细胞核实例分割

    本文提出了一种称为循环学习的新型图像水平弱监督方法，应用于核实例分割，通过将前端分类和后端半监督实例分割任务相结合，循环共享知识，从图像级标签中提取潜在信息，实现更好的优化，其在三个数据集上的实验均表现出优秀的广泛性，并取得了与完全监督方法可比较的性能。

    Jun, 2023

  • 前向 - 前向对比学习

    该研究论文提出了一种基于前向前向对比学习的图像分类预训练方法，通过将前向算法与对比学习结合，可以构建出更加具有鲁棒性的分类模型，实验结果表明该方法可以取得比现有预训练模型更加出色的分类性能。

    May, 2023

  • 一种面向临床的多层次对比学习方法用于低质量医学图像疾病诊断

    提出了一种临床导向的多级对比学习框架，旨在增强模型提取病变特征和区分病变与低质量因素的能力，从而能够更准确地诊断低质量医学图像的疾病。

    Apr, 2024

  • 利用组织病理图像中的部分点注释进行弱监督深度细胞核分割

    本文提出了一种基于部分点注释的弱监督分割框架，其中包括两个阶段的半监督策略和深度神经网络的使用，使得核分割的自动化处理不需要大量的标注数据和额外的计算负担。

    Jul, 2020

  • 弱监督的位置对比学习：肝硬化分类应用

    利用病理学诊断等高置信度标签难以获取而成本高昂，故提出了一种基于弱标签和空间上下文的弱监督位置对比学习策略，通过泛化的基于核的损失函数整合了每个 2D 切片的空间上下文和弱标签，将其应用于肝硬化预测中，相对于基线模型在内部数据集上的分类 AUC 提高了 5％，在公共 LIHC 数据集（Cancer Genome Atlas）上提高了 26％。

    Jul, 2023

  • 三维荧光显微镜图像合成和分割

    本研究提出了一种使用合成 3D 体积进行深度学习核分割的方法，通过空间约束的对抗网络生成一组合成 3D 体积和相应的地面真实数据集，对各种数据集成功地完成了核分割任务。

    Jan, 2018

  • 基于位置的对比学习用于体积医学图像分割

    文章提出了一种基于位置的对比学习 (PCL) 框架，用于从未标记的医学图像数据中生成对比数据对，以改善在医学图像分割中存在的假阴性对的问题，并在 CT 和 MRI 数据集上得到了实验验证。

    Jun, 2021

  • 多尺度注意力多实例学习用于多千兆像素组织学图像分类

    本文提出了一个深度学习管道，以多个实例学习和注意力机制对组织检查图像进行分类，并成功实现了对鼻咽癌的 LMP1 状态预测。通过可视化注意力分数，该方法还允许对模型的解释性进行检查。

    Sep, 2022