Sep, 2023

腹部 CT 中快速、低资源和准确的器官与全癌肿瘤分割的两阶段混合监督框架

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TL;DR提出了一种混合有导师的框架（StMt），通过使用部分标记和未标记的数据进行腹部器官和肿瘤的分割。采用两阶段分割流程和基于整体体积的输入策略，以最大程度地提高分割准确性，并同时满足推断时间和 GPU 内存使用的要求。在 FLARE2023 的验证集上的实验表明，我们的方法在分割性能、速度和资源利用方面都表现优异。平均 DSC 分数为 89.79% 和 45.55%，平均运行时间为 11.25 秒，GPU 内存 - 时间曲线下的面积为 9627.82MB。
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发现论文，激发创造
  • 腹部器官和肿瘤分割的迭代半监督学习

    在这项研究中，我们提出了使用半监督学习和迭代伪标签策略来解决 FLARE23 挑战，在通过完整器官注释数据集训练的深度模型 (nn-UNet) 生成伪标签后，在 FLARE23 数据集上，我们的方法在器官分割和肿瘤分割上取得了优秀的结果。

    Oct, 2023

  • AbdomenCT-1K：腹部器官分割问题已得解决吗？

    该论文介绍了一个大规模的腹部 CT 器官分割数据集 AbdomenCT-1K，其中包括来自 12 个医疗中心的 1000 多个 CT 扫描，并指出现有的分割方法在不同医疗中心、不同阶段和看不见的疾病上存在一定的局限性，提出了用于此类数据的四个器官分割基准以及针对这些基准的简单而有效的方法，这将有助于未来的医学影像研究。

    Oct, 2020

  • FLARE22 挑战赛：在全癌症腹部器官定量中释放未标记数据的优势

    定量器官评估是自动腹部疾病诊断和治疗规划的重要步骤。人工智能（AI）在自动化这一过程中显示出巨大的潜力。为了克服现有 AI 算法在现实世界多国家设置中对准确性和效率的大规模评估以及缺乏全面评估的限制，我们组织了迄今最大规模的腹部器官分析挑战 FLARE 2022 Challenge，旨在评估快速、低资源、准确、注释高效和泛化能力强的 AI 算法。我们从 50 多个医疗团体构建了一个跨洲际和跨国家的数据集，包括来自不同种族、疾病、阶段和制造商的计算机断层扫描（CT 扫描）。我们独立验证了一组 AI 算法通过使用 50 个标记扫描和 2000 个未标记扫描实现了 90.0% 的中位数 Dice 相似系数（DSC），这可以显著减少标注要求。最佳表现的算法成功泛化到保留的外部验证集，分别在北美、欧洲和亚洲队列上实现了中位数 DSC 分别为 89.5%、90.9% 和 88.3%。它们还实现了关键器官生物学特征的自动提取，这在传统的手动测量中需要耗费大量人力。这有望利用未标记数据提升性能并缓解现代 AI 模型的标注短缺问题。

    Aug, 2023

  • 腹部 CT 扫描中胰腺囊肿分割的深度监督

    介绍了一种基于深度学习的胰腺囊肿自动分割方法，通过加入深度监督并基于合理的变换函数，将分割任务分解为不同的步骤，应用于 131 个病理样本中取得了 63.44% 的平均精度（Dice-Sørensen 系数），高于未使用深度学习方法的 60.46%。

    Jun, 2017

  • 腹部多器官和肿瘤分割的持续学习

    本文提出了一种用于连续器官和肿瘤分割任务的创新结构，包括一系列轻量级的、类特定的输出头，以及将对比语言 - 图像预训练嵌入到器官特定的头中。实验结果表明该方法在学习过程中提高了基线神经网络对新引入和先前学习类别的分割性能。

    Jun, 2023

  • 利用 Swinunter 进行 CT 腹部多器官分割

    应用基于转换器的模型进行训练，研究论文中介绍了在计算机断层扫描中腹部多器官分割的重要性以及深度学习方法在此方面的应用。尽管由于器官边界模糊、复杂的背景和不同器官尺度的挑战，单个网络精确分割不同器官仍然具有挑战性。先前的竞赛中基本上所有前五名的方法都使用了基于卷积神经网络的方法，与此相对，本研究中使用基于转换器的模型，并以竞赛中的大量样本为基础，展示了转换器模型在腹部多器官分割中的可行性及结果表现。

    Sep, 2023

  • 自动腹部 MRI 器官分割：基于 CT 标签生成的合成数据的应用

    利用 CT 标签地图生成合成图像，应用于腹部器官分割的 U-Net 网络训练，在 Dice 分数方面与在 MR 数据上训练的完全监督分割方法相比表现出类似的结果。

    Mar, 2024

  • 标签高效的多器官分割方法与扩散模型

    本研究提出了一种使用预训练扩散模型进行 CT 图像的多器官分割任务的标签高效学习方法，该方法仅需要少量标记数据，在有限标记数据场景下取得了竞争性的分割性能。

    Feb, 2024

  • 采用器官注意力网络和统计融合的腹部多器官分割

    使用器官注意力网络，结合反向连接，以 2D 视图特征分割 3D CT 体积中的腹部器官。统计融合不同方向上的 2D 视图，实现准确和鲁棒的分割结果。

    Apr, 2018

  • MRISegmentator-Abdomen: T1 加权腹部 MRI 的全自动多器官和结构分割工具

    提出了一种名为 MRISegmentator 的 T1 加权腹部 MRI 序列的自动、准确和可靠的 62 个脏器和结构的分割工具，具有加速疾病诊断、放射治疗和异常检测等临床研究的潜力。

    May, 2024