May, 2024

MRISegmentator-Abdomen: T1 加权腹部 MRI 的全自动多器官和结构分割工具

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TL;DR提出了一种名为 MRISegmentator 的 T1 加权腹部 MRI 序列的自动、准确和可靠的 62 个脏器和结构的分割工具，具有加速疾病诊断、放射治疗和异常检测等临床研究的潜力。
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发现论文，激发创造
  • TotalSegmentator MRI: MR 图像中 59 个解剖结构的序列无关分割

    我们开发了一个开源且易于使用的分割模型，可以独立于 MR 序列，自动且鲁棒地对大多数主要解剖结构进行分割。

    May, 2024

  • MRSegmentator: MRI 和 CT 序列中 40 个类别的鲁棒多模态分割

    提出了一个能够在 MRI 扫描中进行多器官分割的深度学习模型，通过解决 MRI 分析中分辨率、标准化强度值和序列可变性的挑战，为当前的 MRI 分析限制提供了解决方案。

    May, 2024

  • 自动腹部 MRI 器官分割：基于 CT 标签生成的合成数据的应用

    利用 CT 标签地图生成合成图像，应用于腹部器官分割的 U-Net 网络训练，在 Dice 分数方面与在 MR 数据上训练的完全监督分割方法相比表现出类似的结果。

    Mar, 2024

  • AbdomenCT-1K：腹部器官分割问题已得解决吗？

    该论文介绍了一个大规模的腹部 CT 器官分割数据集 AbdomenCT-1K，其中包括来自 12 个医疗中心的 1000 多个 CT 扫描，并指出现有的分割方法在不同医疗中心、不同阶段和看不见的疾病上存在一定的局限性，提出了用于此类数据的四个器官分割基准以及针对这些基准的简单而有效的方法，这将有助于未来的医学影像研究。

    Oct, 2020

  • CHAOS 挑战 -- 联合（CT-MR）健康腹部器官分割

    本文介绍了机器学习在人腹部器官分类中的应用，通过分析深度学习模型在肝脏和全部器官的单模态（CT / MR）和异模态任务上的性能表现，在多个任务中有不同表现。

    Jan, 2020

  • 腹部 CT 中快速、低资源和准确的器官与全癌肿瘤分割的两阶段混合监督框架

    提出了一种混合有导师的框架（StMt），通过使用部分标记和未标记的数据进行腹部器官和肿瘤的分割。采用两阶段分割流程和基于整体体积的输入策略，以最大程度地提高分割准确性，并同时满足推断时间和 GPU 内存使用的要求。在 FLARE2023 的验证集上的实验表明，我们的方法在分割性能、速度和资源利用方面都表现优异。平均 DSC 分数为 89.79% 和 45.55%，平均运行时间为 11.25 秒，GPU 内存 - 时间曲线下的面积为 9627.82MB。

    Sep, 2023

  • AMOS: 用于多样化医学图像分割的大规模腹部多器官基准

    介绍了 AMOS 数据集，用于细分包含多个器官的腹部 CT/MRI 图像，并对该数据集上使用的多种深度学习模型进行了基准测试。

    Jun, 2022

  • 临床情境中的腹部器官分割重思（RAOS）：具有挑战性案例的鲁棒性评估基准

    深度学习在腹部多器官分割方面取得了巨大的进展，但在边缘情况和复杂器官上的鲁棒性仍然是一个具有挑战性的问题。为了调查模型的鲁棒性，我们收集并注释了 RAOS 数据集，包括 413 名患者的 413 个 CT 扫描，涵盖了诊断 / 放疗、部分切除和完全切除三个临床组。该数据集可以作为评估模型鲁棒性的潜在基准，并提供了一些在公共数据集中很难获取的器官。我们对几种最先进的方法在这三个临床组中进行了基准测试，评估了性能和鲁棒性，并评估了 RAOS 与三个公共数据集之间的交叉泛化能力。该数据集和综合分析为未来鲁棒性研究提供了一个潜在的基准。

    Jun, 2024

  • 网格与体素结合：基于差形变形的腹部器官分割

    本文提出了一种新的、基于 UNetFlow 的异形形状变形方法，用于三维腹部器官提取，与现有方法相比，具有更高的准确性和拓扑正确性，可以广泛应用于 CT 和 MRI 数据分析。

    Jun, 2023

  • 利用 Swinunter 进行 CT 腹部多器官分割

    应用基于转换器的模型进行训练，研究论文中介绍了在计算机断层扫描中腹部多器官分割的重要性以及深度学习方法在此方面的应用。尽管由于器官边界模糊、复杂的背景和不同器官尺度的挑战，单个网络精确分割不同器官仍然具有挑战性。先前的竞赛中基本上所有前五名的方法都使用了基于卷积神经网络的方法，与此相对，本研究中使用基于转换器的模型，并以竞赛中的大量样本为基础，展示了转换器模型在腹部多器官分割中的可行性及结果表现。

    Sep, 2023